நோயாளியின் சீரம் உயர் தெளிவுத்திறன் கொண்ட மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரிக் பகுப்பாய்வைப் பயன்படுத்தி அதிக விவரக்குறிப்புடன் தீங்கற்ற மற்றும் வீரியம் மிக்க நுரையீரல் முடிச்சுகளை வேறுபடுத்தும் வளர்சிதை மாற்றவியல்.

கம்ப்யூட்டட் டோமோகிராபி (CT) மூலம் அடையாளம் காணப்பட்ட நுரையீரல் முடிச்சுகளின் வேறுபட்ட நோயறிதல் மருத்துவ நடைமுறையில் ஒரு சவாலாக உள்ளது.ஆரோக்கியமான கட்டுப்பாடுகள், தீங்கற்ற நுரையீரல் முடிச்சுகள் மற்றும் நிலை I நுரையீரல் அடினோகார்சினோமா உள்ளிட்ட 480 சீரம் மாதிரிகளின் உலகளாவிய வளர்சிதை மாற்றத்தை இங்கே வகைப்படுத்துகிறோம்.அடினோகார்சினோமாக்கள் தனித்துவமான வளர்சிதை மாற்ற சுயவிவரங்களை வெளிப்படுத்துகின்றன, அதேசமயம் தீங்கற்ற முடிச்சுகள் மற்றும் ஆரோக்கியமான நபர்கள் வளர்சிதை மாற்ற சுயவிவரங்களில் அதிக ஒற்றுமையைக் கொண்டுள்ளனர்.கண்டுபிடிப்பு குழுவில் (n = 306), தீங்கற்ற மற்றும் வீரியம் மிக்க முடிச்சுகளை வேறுபடுத்துவதற்கு 27 வளர்சிதை மாற்றங்களின் தொகுப்பு அடையாளம் காணப்பட்டது.அக சரிபார்ப்பு (n = 104) மற்றும் வெளிப்புற சரிபார்ப்பு (n = 111) குழுக்களில் உள்ள பாகுபாடு மாதிரியின் AUC முறையே 0.915 மற்றும் 0.945 ஆகும்.பாதை பகுப்பாய்வு, தீங்கற்ற முடிச்சுகள் மற்றும் ஆரோக்கியமான கட்டுப்பாடுகளுடன் ஒப்பிடும்போது நுரையீரல் அடினோகார்சினோமா சீரத்தில் டிரிப்டோபனின் குறைவுடன் தொடர்புடைய கிளைகோலைடிக் வளர்சிதை மாற்றங்களை வெளிப்படுத்தியது, மேலும் டிரிப்டோபான் உட்கொள்ளல் நுரையீரல் புற்றுநோய் செல்களில் கிளைகோலிசிஸை ஊக்குவிக்கிறது என்று பரிந்துரைத்தது.CT ஆல் கண்டறியப்பட்ட நுரையீரல் முடிச்சுகளின் அபாயத்தை மதிப்பிடுவதில் சீரம் மெட்டாபொலைட் பயோமார்க்ஸர்களின் மதிப்பை எங்கள் ஆய்வு எடுத்துக்காட்டுகிறது.
புற்றுநோயாளிகளின் உயிர்வாழ்வு விகிதங்களை மேம்படுத்த ஆரம்பகால நோயறிதல் முக்கியமானது.யுஎஸ் நேஷனல் லங் கேன்சர் ஸ்கிரீனிங் ட்ரையல் (என்எல்எஸ்டி) மற்றும் ஐரோப்பிய நெல்சன் ஆய்வின் முடிவுகள், குறைந்த-டோஸ் கம்ப்யூட்டட் டோமோகிராபி (எல்டிசிடி) மூலம் ஸ்கிரீனிங் செய்வது அதிக ஆபத்துள்ள குழுக்களில் நுரையீரல் புற்றுநோய் இறப்பைக் கணிசமாகக் குறைக்கும் என்பதைக் காட்டுகிறது.நுரையீரல் புற்றுநோய் ஸ்கிரீனிங்கிற்கு LDCT பரவலாகப் பயன்படுத்தப்பட்டதிலிருந்து, அறிகுறியற்ற நுரையீரல் முடிச்சுகளின் தற்செயலான கதிரியக்க கண்டுபிடிப்புகளின் நிகழ்வுகள் தொடர்ந்து அதிகரித்து வருகின்றன.நுரையீரல் முடிச்சுகள் 5 விட்டம் 3 செமீ வரை குவிய ஒளிபுகாநிலைகளாக வரையறுக்கப்படுகின்றன.எல்.டி.சி.டியில் தற்செயலாக கண்டறியப்பட்ட அதிக எண்ணிக்கையிலான நுரையீரல் முடிச்சுகளைக் கையாள்வதில் வீரியம் ஏற்படுவதற்கான சாத்தியக்கூறுகளை மதிப்பிடுவதில் நாங்கள் சிரமங்களை எதிர்கொள்கிறோம்.CT இன் வரம்புகள் அடிக்கடி பின்தொடர்தல் பரிசோதனைகள் மற்றும் தவறான-நேர்மறையான முடிவுகளுக்கு வழிவகுக்கும், இது தேவையற்ற தலையீடு மற்றும் அதிகப்படியான சிகிச்சைக்கு வழிவகுக்கும்.எனவே, ஆரம்ப நிலைகளில் நுரையீரல் புற்றுநோயை சரியாக அடையாளம் காண நம்பகமான மற்றும் பயனுள்ள உயிரியல் குறிப்பான்களை உருவாக்க வேண்டிய அவசியம் உள்ளது மற்றும் ஆரம்ப கண்டறிதல் 7 இல் மிகவும் தீங்கற்ற முடிச்சுகளை வேறுபடுத்துகிறது.
இரத்தத்தின் விரிவான மூலக்கூறு பகுப்பாய்வு (சீரம், பிளாஸ்மா, புற இரத்த மோனோநியூக்ளியர் செல்கள்), ஜீனோமிக்ஸ், புரோட்டியோமிக்ஸ் அல்லது டிஎன்ஏ மெத்திலேஷன்8,9,10 உட்பட, நுரையீரல் புற்றுநோயைக் கண்டறியும் பயோமார்க்ஸைக் கண்டுபிடிப்பதில் ஆர்வத்தை அதிகரிக்க வழிவகுத்தது.இதற்கிடையில், வளர்சிதை மாற்ற அணுகுமுறைகள் செல்லுலார் இறுதி தயாரிப்புகளை அளவிடுகின்றன, அவை எண்டோஜெனஸ் மற்றும் வெளிப்புற செயல்களால் பாதிக்கப்படுகின்றன, எனவே நோயின் தொடக்கத்தையும் விளைவுகளையும் கணிக்கப் பயன்படுகிறது.திரவ குரோமடோகிராபி-டேண்டம் மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி (எல்சி-எம்எஸ்) என்பது அதன் அதிக உணர்திறன் மற்றும் பெரிய டைனமிக் வரம்பு காரணமாக வளர்சிதை மாற்ற ஆய்வுகளுக்கு பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படும் முறையாகும், இது வெவ்வேறு இயற்பியல் வேதியியல் பண்புகளுடன் வளர்சிதை மாற்றங்களை உள்ளடக்கும்.நுரையீரல் புற்றுநோய் கண்டறிதல் 14,15,16,17 மற்றும் சிகிச்சையின் செயல்திறன் ஆகியவற்றுடன் தொடர்புடைய உயிரியக்க குறிப்பான்களை அடையாளம் காண பிளாஸ்மா/சீரத்தின் உலகளாவிய வளர்சிதை மாற்ற பகுப்பாய்வு பயன்படுத்தப்பட்டாலும், தீங்கற்ற மற்றும் வீரியம் மிக்க நுரையீரல் முடிச்சுகளை வேறுபடுத்துவதற்கான 18 சீரம் மெட்டாபொலைட் வகைப்படுத்திகள் அதிகம் ஆய்வு செய்யப்படுகின்றன.- பாரிய ஆராய்ச்சி.
அடினோகார்சினோமா மற்றும் ஸ்குவாமஸ் செல் கார்சினோமா ஆகியவை சிறிய அல்லாத உயிரணு நுரையீரல் புற்றுநோயின் (NSCLC) இரண்டு முக்கிய துணை வகைகளாகும்.நுரையீரல் புற்றுநோயின் மிகவும் பொதுவான ஹிஸ்டாலஜிக்கல் வகை அடினோகார்சினோமா என்று பல்வேறு CT ஸ்கிரீனிங் சோதனைகள் குறிப்பிடுகின்றன1,19,20,21.இந்த ஆய்வில், ஆரோக்கியமான கட்டுப்பாடுகள், தீங்கற்ற நுரையீரல் முடிச்சுகள் மற்றும் CT-கண்டறியப்பட்ட ≤3 செமீ உட்பட மொத்தம் 695 சீரம் மாதிரிகளில் வளர்சிதை மாற்ற பகுப்பாய்வு செய்ய அல்ட்ரா-செயல்திறன் திரவ குரோமடோகிராபி-ஹை-ரெசல்யூஷன் மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி (UPLC-HRMS) ஐப் பயன்படுத்தினோம்.நிலை I நுரையீரல் அடினோகார்சினோமாவுக்கான ஸ்கிரீனிங்.நுரையீரல் அடினோகார்சினோமாவை தீங்கற்ற முடிச்சுகள் மற்றும் ஆரோக்கியமான கட்டுப்பாடுகளிலிருந்து வேறுபடுத்தும் சீரம் வளர்சிதை மாற்றங்களின் குழுவை நாங்கள் அடையாளம் கண்டுள்ளோம்.பாதை செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வு, தீங்கற்ற முடிச்சுகள் மற்றும் ஆரோக்கியமான கட்டுப்பாடுகளுடன் ஒப்பிடும்போது நுரையீரல் அடினோகார்சினோமாவில் அசாதாரணமான டிரிப்டோபான் மற்றும் குளுக்கோஸ் வளர்சிதை மாற்றம் பொதுவான மாற்றங்களாகும்.இறுதியாக, எல்.டி.சி.டி மூலம் கண்டறியப்பட்ட வீரியம் மிக்க மற்றும் தீங்கற்ற நுரையீரல் முடிச்சுகளை வேறுபடுத்துவதற்கு அதிக விவரக்குறிப்பு மற்றும் உணர்திறன் கொண்ட சீரம் வளர்சிதை மாற்ற வகைப்படுத்தியை நாங்கள் நிறுவி சரிபார்த்தோம், இது ஆரம்பகால வேறுபட்ட நோயறிதல் மற்றும் இடர் மதிப்பீட்டிற்கு உதவும்.
தற்போதைய ஆய்வில், பாலினம் மற்றும் வயதுக்கு ஏற்ற சீரம் மாதிரிகள் 174 ஆரோக்கியமான கட்டுப்பாடுகள், தீங்கற்ற நுரையீரல் முடிச்சுகள் கொண்ட 292 நோயாளிகள் மற்றும் நிலை I நுரையீரல் அடினோகார்சினோமா கொண்ட 229 நோயாளிகளிடமிருந்து பின்னோக்கி சேகரிக்கப்பட்டன.695 பாடங்களின் மக்கள்தொகை பண்புகள் துணை அட்டவணை 1 இல் காட்டப்பட்டுள்ளன.
படம் 1a இல் காட்டப்பட்டுள்ளபடி, 174 ஆரோக்கியமான கட்டுப்பாடு (HC), 170 தீங்கற்ற முடிச்சுகள் (BN) மற்றும் 136 நிலை I நுரையீரல் அடினோகார்சினோமா (LA) மாதிரிகள் உட்பட மொத்தம் 480 சீரம் மாதிரிகள் சன் யாட்-சென் பல்கலைக்கழக புற்றுநோய் மையத்தில் சேகரிக்கப்பட்டன.அல்ட்ரா-செயல்திறன் திரவ குரோமடோகிராபி-ஹை-ரெசல்யூஷன் மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி (யுபிஎல்சி-எச்ஆர்எம்எஸ்) ஐப் பயன்படுத்தி இலக்கற்ற வளர்சிதை மாற்ற விவரக்குறிப்புக்கான டிஸ்கவரி கோஹார்ட்.துணை படம் 1 இல் காட்டப்பட்டுள்ளபடி, LA மற்றும் HC, LA மற்றும் BN ஆகியவற்றுக்கு இடையேயான வேறுபட்ட வளர்சிதை மாற்றங்கள் ஒரு வகைப்பாடு மாதிரியை நிறுவவும் மேலும் வேறுபட்ட பாதை பகுப்பாய்வை ஆராயவும் அடையாளம் காணப்பட்டன.சன் யாட்-சென் பல்கலைக்கழக புற்றுநோய் மையத்தால் சேகரிக்கப்பட்ட 104 மாதிரிகள் மற்றும் மற்ற இரண்டு மருத்துவமனைகளால் சேகரிக்கப்பட்ட 111 மாதிரிகள் முறையே உள் மற்றும் வெளிப்புற சரிபார்ப்புக்கு உட்படுத்தப்பட்டன.
தீவிர செயல்திறன் திரவ குரோமடோகிராபி-உயர் தெளிவுத்திறன் கொண்ட மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி (UPLC-HRMS) ஐப் பயன்படுத்தி உலகளாவிய சீரம் வளர்சிதை மாற்ற பகுப்பாய்வுக்கு உட்பட்ட கண்டுபிடிப்பு குழுவில் உள்ள ஒரு ஆய்வு மக்கள்.b ஆரோக்கியமான கட்டுப்பாடுகள் (HC, n = 174), தீங்கற்ற முடிச்சுகள் (BN, n = 170) மற்றும் நிலை I நுரையீரல் அடினோகார்சினோமா உட்பட, ஆய்வுக் குழுவிலிருந்து 480 சீரம் மாதிரிகளின் மொத்த வளர்சிதை மாற்றத்தின் பகுதியளவு குறைந்த சதுரங்கள் பாகுபாடு பகுப்பாய்வு (PLS-DA). (லாஸ் ஏஞ்சல்ஸ், n = 136).+ESI, நேர்மறை எலக்ட்ரோஸ்ப்ரே அயனியாக்கம் முறை, -ESI, எதிர்மறை எலக்ட்ரோஸ்ப்ரே அயனியாக்கம் முறை.இரண்டு கொடுக்கப்பட்ட குழுக்களில் (இரண்டு-வால் கொண்ட வில்காக்சன் கையொப்பமிடப்பட்ட தரவரிசை சோதனை, தவறான கண்டுபிடிப்பு விகிதம் சரிசெய்யப்பட்ட p மதிப்பு, FDR <0.05) கணிசமாக வேறுபட்ட மிகுதியுடன் கூடிய c-e வளர்சிதை மாற்றங்கள் சிவப்பு (மடிப்பு மாற்றம் > 1.2) மற்றும் நீலம் (மடிப்பு மாற்றம் <0.83) .) எரிமலை கிராஃபிக் காட்டப்பட்டுள்ளது.f படிநிலை கிளஸ்டரிங் வெப்ப வரைபடம் LA மற்றும் BN இடையே சிறுகுறிப்பு செய்யப்பட்ட வளர்சிதை மாற்றங்களின் எண்ணிக்கையில் குறிப்பிடத்தக்க வேறுபாடுகளைக் காட்டுகிறது.மூல தரவு மூல தரவு கோப்புகளின் வடிவத்தில் வழங்கப்படுகிறது.
கண்டுபிடிப்பு குழுவில் 174 HC, 170 BN மற்றும் 136 LA ஆகியவற்றின் மொத்த சீரம் வளர்சிதை மாற்றம் UPLC-HRMS பகுப்பாய்வு மூலம் பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டது.தற்போதைய ஆய்வின் செயல்திறனின் ஸ்திரத்தன்மையை உறுதிப்படுத்தும், மேற்பார்வை செய்யப்படாத முதன்மை கூறு பகுப்பாய்வு (PCA) மாதிரியின் மையத்தில் தரக் கட்டுப்பாடு (QC) மாதிரிகள் இறுக்கமாக இருப்பதை நாங்கள் முதலில் காட்டுகிறோம் (துணை படம் 2).
படம் 1 b இல் உள்ள பகுதி குறைந்த சதுரங்கள்-பாகுபாடு பகுப்பாய்வு (PLS-DA) இல் காட்டப்பட்டுள்ளபடி, நேர்மறை (+ESI) மற்றும் எதிர்மறை (-ESI) எலக்ட்ரோஸ்ப்ரே அயனியாக்கம் முறைகளில் LA மற்றும் BN, LA மற்றும் HC க்கு இடையே தெளிவான வேறுபாடுகள் இருப்பதைக் கண்டறிந்தோம். .தனிமைப்படுத்தப்பட்டது.இருப்பினும், +ESI மற்றும் -ESI நிலைகளில் BN மற்றும் HC இடையே குறிப்பிடத்தக்க வேறுபாடுகள் எதுவும் காணப்படவில்லை.
LA மற்றும் HC க்கு இடையில் 382 வேறுபட்ட அம்சங்களையும், LA மற்றும் BN க்கு இடையில் 231 வேறுபட்ட அம்சங்களையும், BN மற்றும் HC க்கு இடையில் 95 வேறுபட்ட அம்சங்களையும் கண்டறிந்தோம் (வில்காக்சன் கையொப்பமிட்ட தரவரிசை சோதனை, FDR <0.05 மற்றும் பல மாற்றம் >1.2 அல்லது <0.83) (படம் .1c-e ).ஒரு தரவுத்தளத்திற்கு (mzCloud/HMDB/Chemspider நூலகம்) எதிராக சிகரங்கள் மேலும் சிறுகுறிப்பு செய்யப்பட்டன (m/z மதிப்பு, தக்கவைப்பு நேரம் மற்றும் துண்டு துண்டான மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரம் தேடல் (முறைகள் பிரிவில் விவரிக்கப்பட்டுள்ள விவரங்கள்) 22 .இறுதியாக, LA மற்றும் BN (படம் 1f மற்றும் துணை அட்டவணை 2) மற்றும் LA மற்றும் HC (துணை படம் 3 மற்றும் துணை அட்டவணை 2) ஆகியவற்றுக்கு முறையே குறிப்பிடத்தக்க வேறுபாடுகளுடன் 33 மற்றும் 38 சிறுகுறிப்பு செய்யப்பட்ட வளர்சிதை மாற்றங்கள் அடையாளம் காணப்பட்டன.இதற்கு நேர்மாறாக, PLS-DA இல் BN மற்றும் HC க்கு இடையே உள்ள ஒன்றுடன் ஒன்று ஒத்துப்போகும் BN மற்றும் HC (துணை அட்டவணை 2) இல் ஏராளமாக குறிப்பிடத்தக்க வேறுபாடுகளைக் கொண்ட 3 வளர்சிதை மாற்றங்கள் மட்டுமே அடையாளம் காணப்பட்டன.இந்த மாறுபட்ட வளர்சிதை மாற்றங்கள் பரந்த அளவிலான உயிர்வேதிப்பொருட்களை உள்ளடக்கியது (துணை படம் 4).ஒன்றாக எடுத்துக்கொண்டால், இந்த முடிவுகள் சீரம் வளர்சிதை மாற்றத்தில் குறிப்பிடத்தக்க மாற்றங்களை நிரூபிக்கின்றன, இது தீங்கற்ற நுரையீரல் முடிச்சுகள் அல்லது ஆரோக்கியமான பாடங்களுடன் ஒப்பிடும்போது ஆரம்ப-நிலை நுரையீரல் புற்றுநோயின் வீரியம் மிக்க மாற்றத்தை பிரதிபலிக்கிறது.இதற்கிடையில், BN மற்றும் HC இன் சீரம் வளர்சிதை மாற்றத்தின் ஒற்றுமை, தீங்கற்ற நுரையீரல் முடிச்சுகள் ஆரோக்கியமான நபர்களுடன் பல உயிரியல் பண்புகளைப் பகிர்ந்து கொள்ளலாம் என்று கூறுகிறது.நுரையீரல் அடினோகார்சினோமா துணை வகை 23 இல் எபிடெர்மல் வளர்ச்சி காரணி ஏற்பி (EGFR) மரபணு மாற்றங்கள் பொதுவானவை என்பதால், சீரம் வளர்சிதை மாற்றத்தில் இயக்கி பிறழ்வுகளின் தாக்கத்தை நாங்கள் தீர்மானிக்க முயன்றோம்.நுரையீரல் அடினோகார்சினோமா குழுவில் EGFR நிலையுடன் 72 வழக்குகளின் ஒட்டுமொத்த வளர்சிதை மாற்ற சுயவிவரத்தை நாங்கள் பகுப்பாய்வு செய்தோம்.சுவாரஸ்யமாக, பிசிஏ பகுப்பாய்வில் (துணை படம் 5a) EGFR விகாரி நோயாளிகள் (n = 41) மற்றும் EGFR காட்டு-வகை நோயாளிகளுக்கு (n = 31) இடையே ஒப்பிடக்கூடிய சுயவிவரங்களைக் கண்டறிந்தோம்.எவ்வாறாயினும், காட்டு-வகை EGFR (t சோதனை, p <0.05 மற்றும் மடிப்பு மாற்றம்> 1.2 அல்லது <0.83) (துணை படம் 5b) நோயாளிகளுடன் ஒப்பிடும்போது EGFR பிறழ்வு கொண்ட நோயாளிகளில் 7 வளர்சிதை மாற்றங்களை நாங்கள் கண்டறிந்தோம்.இந்த வளர்சிதை மாற்றங்களில் பெரும்பாலானவை (7 இல் 5) அசில்கார்னிடைன்கள் ஆகும், அவை கொழுப்பு அமில ஆக்சிஜனேற்ற பாதைகளில் முக்கிய பங்கு வகிக்கின்றன.
படம் 2 a இல் காட்டப்பட்டுள்ள பணிப்பாய்வுகளில் விளக்கப்பட்டுள்ளபடி, முடிச்சு வகைப்பாட்டிற்கான பயோமார்க்ஸர்கள் குறைந்தபட்சம் முழுமையான சுருக்க ஆபரேட்டர்களைப் பயன்படுத்தி பெறப்பட்டன மற்றும் LA (n = 136) மற்றும் BN (n = 170) ஆகியவற்றில் அடையாளம் காணப்பட்ட 33 வேறுபட்ட வளர்சிதை மாற்றங்களின் அடிப்படையில் தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டன.மாறிகளின் சிறந்த கலவை (LASSO) - பைனரி லாஜிஸ்டிக் பின்னடைவு மாதிரி.மாதிரியின் நம்பகத்தன்மையை சோதிக்க பத்து மடங்கு குறுக்கு சரிபார்ப்பு பயன்படுத்தப்பட்டது.மாறி தேர்வு மற்றும் அளவுரு முறைப்படுத்துதல் ஆகியவை λ24 அளவுருவுடன் கூடிய சாத்தியக்கூறு அதிகபட்ச அபராதம் மூலம் சரிசெய்யப்படுகின்றன.பாரபட்சமான மாதிரியின் வகைப்பாடு செயல்திறனைச் சோதிக்க உள் சரிபார்ப்பு (n = 104) மற்றும் வெளிப்புற சரிபார்ப்பு (n = 111) குழுக்களில் உலகளாவிய வளர்சிதை மாற்ற பகுப்பாய்வு மேலும் சுயாதீனமாக செய்யப்பட்டது.இதன் விளைவாக, கண்டுபிடிப்புத் தொகுப்பில் உள்ள 27 மெட்டாபொலிட்டுகள் மிகப்பெரிய சராசரி AUC மதிப்பு (படம் 2b) கொண்ட சிறந்த பாரபட்சமான மாதிரியாக அடையாளம் காணப்பட்டன, அவற்றில் 9 ஆனது BN உடன் ஒப்பிடும்போது LA இல் அதிகரித்த செயல்பாடு மற்றும் 18 செயல்பாடு குறைந்துள்ளது (படம் 2c).
ஒரு நுரையீரல் முடிச்சு வகைப்படுத்தியை உருவாக்குவதற்கான பணிப்பாய்வு, பத்து மடங்கு குறுக்கு சரிபார்ப்பு மூலம் பைனரி லாஜிஸ்டிக் பின்னடைவு மாதிரியைப் பயன்படுத்தி கண்டுபிடிப்புத் தொகுப்பில் சீரம் மெட்டாபொலிட்டுகளின் சிறந்த பேனலைத் தேர்ந்தெடுப்பது மற்றும் உள் மற்றும் வெளிப்புற சரிபார்ப்பு தொகுப்புகளில் முன்கணிப்பு செயல்திறனை மதிப்பீடு செய்வது உட்பட.b வளர்சிதை மாற்ற பயோமார்க்கர் தேர்வுக்கான LASSO பின்னடைவு மாதிரியின் குறுக்கு சரிபார்ப்பு புள்ளிவிவரங்கள்.மேலே கொடுக்கப்பட்ட எண்கள் கொடுக்கப்பட்ட λ இல் தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட பயோமார்க்ஸர்களின் சராசரி எண்ணிக்கையைக் குறிக்கின்றன.சிவப்பு புள்ளியிடப்பட்ட கோடு தொடர்புடைய லாம்ப்டாவில் சராசரி AUC மதிப்பைக் குறிக்கிறது.சாம்பல் பிழை பார்கள் குறைந்தபட்ச மற்றும் அதிகபட்ச AUC மதிப்புகளைக் குறிக்கின்றன.புள்ளியிடப்பட்ட கோடு 27 தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட பயோமார்க்ஸர்களுடன் சிறந்த மாதிரியைக் குறிக்கிறது.AUC, ரிசீவர் இயக்க பண்பு (ROC) வளைவின் கீழ் பகுதி.c கண்டுபிடிப்புக் குழுவில் உள்ள BN குழுவுடன் ஒப்பிடும்போது LA குழுவில் தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட 27 வளர்சிதை மாற்றங்களின் மடங்கு மாற்றங்கள்.சிவப்பு நெடுவரிசை - செயல்படுத்தல்.நீல நெடுவரிசை ஒரு சரிவு.d-f ரிசீவர் இயங்கு பண்பு (ROC) வளைவுகள், கண்டுபிடிப்பு, உள் மற்றும் வெளிப்புற சரிபார்ப்பு தொகுப்புகளில் 27 மெட்டாபொலைட் சேர்க்கைகளின் அடிப்படையில் பாரபட்சமான மாதிரியின் சக்தியைக் காட்டுகிறது.மூல தரவு மூல தரவு கோப்புகளின் வடிவத்தில் வழங்கப்படுகிறது.
இந்த 27 வளர்சிதை மாற்றங்களின் எடையுள்ள பின்னடைவு குணகங்களின் அடிப்படையில் ஒரு முன்கணிப்பு மாதிரி உருவாக்கப்பட்டது (துணை அட்டவணை 3).இந்த 27 வளர்சிதை மாற்றங்களின் அடிப்படையில் ROC பகுப்பாய்வு வளைவு (AUC) மதிப்பு 0.933 இன் கீழ் ஒரு பகுதியை அளித்தது, கண்டுபிடிப்பு குழு உணர்திறன் 0.868, மற்றும் விவரக்குறிப்பு 0.859 (படம் 2d).இதற்கிடையில், LA மற்றும் HC க்கு இடையிலான 38 சிறுகுறிப்பு வேறுபட்ட வளர்சிதை மாற்றங்களில், 16 வளர்சிதை மாற்றங்களின் தொகுப்பு 0.902 இன் AUC ஐ 0.801 உணர்திறன் மற்றும் 0.856 இன் தனித்தன்மையுடன் LA ஐ HC இலிருந்து பாகுபடுத்துவதில் அடைந்தது (துணை படம் 6a-c).மாறுபட்ட வளர்சிதை மாற்றங்களுக்கான வெவ்வேறு மடங்கு மாற்ற வரம்புகளின் அடிப்படையில் AUC மதிப்புகள் ஒப்பிடப்பட்டன.LA மற்றும் BN (HC) ஆகியவற்றுக்கு இடையே 1.2 மற்றும் 1.5 அல்லது 2.0 (துணை படம் 7a,b) என மடிப்பு மாற்ற நிலை அமைக்கப்படும் போது வகைப்படுத்தல் மாதிரி சிறப்பாக செயல்பட்டதைக் கண்டறிந்தோம்.27 வளர்சிதை மாற்றக் குழுக்களை அடிப்படையாகக் கொண்ட வகைப்பாடு மாதிரியானது, உள் மற்றும் வெளிப்புறக் குழுக்களில் மேலும் சரிபார்க்கப்பட்டது.AUC ஆனது அகச் சரிபார்ப்புக்கு 0.915 (உணர்திறன் 0.867, குறிப்பிட்ட தன்மை 0.811) மற்றும் வெளிப்புற சரிபார்ப்புக்கு 0.945 (உணர்திறன் 0.810, விவரக்குறிப்பு 0.979) (படம். 2e, f).ஆய்வக செயல்திறனை மதிப்பிடுவதற்கு, முறைகள் பிரிவில் விவரிக்கப்பட்டுள்ளபடி வெளிப்புற ஆய்வகத்தில் இருந்து 40 மாதிரிகள் பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டன.வகைப்பாடு துல்லியம் 0.925 AUC ஐ அடைந்தது (துணை படம் 8).நுரையீரல் அடினோகார்சினோமா (LUAD) க்குப் பிறகு சிறிய அல்லாத உயிரணு நுரையீரல் புற்றுநோயின் (NSCLC) இரண்டாவது பொதுவான துணை வகை நுரையீரல் ஸ்குவாமஸ் செல் கார்சினோமா (LUSC) என்பதால், வளர்சிதை மாற்ற சுயவிவரங்களின் சரிபார்க்கப்பட்ட சாத்தியமான பயன்பாட்டையும் நாங்கள் சோதித்தோம்.BN மற்றும் LUSC இன் 16 வழக்குகள்.LUSC மற்றும் BN இடையேயான பாகுபாட்டின் AUC 0.776 (துணை படம் 9), இது LUAD மற்றும் BN இடையேயான பாகுபாட்டுடன் ஒப்பிடும்போது மோசமான திறனைக் குறிக்கிறது.
CT படங்களில் உள்ள முடிச்சுகளின் அளவு வீரியம் ஏற்படுவதற்கான சாத்தியக்கூறுகளுடன் நேர்மறையாக தொடர்புடையது மற்றும் முடிச்சு சிகிச்சையின் முக்கிய நிர்ணயம் 25,26,27 என்று ஆய்வுகள் காட்டுகின்றன.NELSON ஸ்கிரீனிங் ஆய்வின் பெரிய குழுவிலிருந்து தரவின் பகுப்பாய்வு, முனைகள் <5 மிமீ உள்ள பாடங்களில் வீரியம் மிக்க ஆபத்து முனைகள் 28 இல்லாத பாடங்களில் இருப்பதைப் போலவே உள்ளது என்பதைக் காட்டுகிறது.எனவே, வழக்கமான CT கண்காணிப்பு தேவைப்படும் குறைந்தபட்ச அளவு, பிரிட்டிஷ் தொராசிக் சொசைட்டி (BTS) பரிந்துரைத்தபடி 5 மிமீ மற்றும் ஃப்ளீஷ்னர் சொசைட்டி 29 பரிந்துரைத்தபடி 6 மிமீ ஆகும்.இருப்பினும், 6 மிமீக்கு மேல் பெரிய மற்றும் வெளிப்படையான தீங்கற்ற அம்சங்கள் இல்லாத முடிச்சுகள், மருத்துவ நடைமுறையில் மதிப்பீடு மற்றும் மேலாண்மையில் பெரும் சவாலாக உள்ளன.கண்டுபிடிப்பு மற்றும் உள் சரிபார்ப்பு கூட்டாளர்களிடமிருந்து சேகரிக்கப்பட்ட மாதிரிகளைப் பயன்படுத்தி வளர்சிதை மாற்ற கையொப்பங்களை முடிச்சு அளவு பாதித்ததா என்பதை நாங்கள் அடுத்து ஆய்வு செய்தோம்.27 சரிபார்க்கப்பட்ட பயோமார்க்ஸில் கவனம் செலுத்தி, முதலில் HC மற்றும் BN சப்-6 மிமீ வளர்சிதை மாற்றங்களின் பிசிஏ சுயவிவரங்களை ஒப்பிட்டுப் பார்த்தோம்.HC மற்றும் BNக்கான பெரும்பாலான தரவுப் புள்ளிகள் ஒன்றுடன் ஒன்று இருப்பதைக் கண்டறிந்தோம், இரு குழுக்களிலும் சீரம் மெட்டாபொலைட் அளவுகள் ஒரே மாதிரியாக இருப்பதை நிரூபிக்கிறது (படம் 3a).வெவ்வேறு அளவு வரம்புகளில் உள்ள அம்ச வரைபடங்கள் BN மற்றும் LA (படம் 3b, c) இல் பாதுகாக்கப்பட்டன, அதேசமயம் 6-20 மிமீ வரம்பில் உள்ள வீரியம் மிக்க மற்றும் தீங்கற்ற முடிச்சுகளுக்கு இடையே ஒரு பிரிப்பு காணப்பட்டது (படம் 3d).இந்த குழுவானது 0.927 AUC, 0.868 இன் தனித்தன்மை மற்றும் 0.820 உணர்திறன் 6 முதல் 20 மிமீ (படம் 3e, f) அளவிடும் முடிச்சுகளின் வீரியம் மிக்க தன்மையைக் கணித்துள்ளது.முடிச்சு அளவைப் பொருட்படுத்தாமல், ஆரம்பகால வீரியம் மிக்க மாற்றத்தால் ஏற்படும் வளர்சிதை மாற்ற மாற்றங்களை வகைப்படுத்தி கைப்பற்ற முடியும் என்பதை எங்கள் முடிவுகள் காட்டுகின்றன.
விளம்பரம் 27 வளர்சிதை மாற்றங்களின் வளர்சிதை மாற்ற வகைப்பாட்டின் அடிப்படையில் குறிப்பிட்ட குழுக்களுக்கு இடையேயான பிசிஏ சுயவிவரங்களின் ஒப்பீடு.CC மற்றும் BN <6 மிமீ.b BN <6 மிமீ எதிராக BN 6-20 மிமீ.LA 6-20 மிமீ மற்றும் LA 20-30 மிமீ.g BN 6-20 மிமீ மற்றும் LA 6-20 மிமீ.GC, n = 174;BN <6 மிமீ, n = 153;BN 6-20 மிமீ, n = 91;LA 6-20 மிமீ, n = 89;LA 20-30 மிமீ, n = 77. இ ரிசீவர் இயக்க பண்பு (ROC) வளைவு 6-20 மிமீ முடிச்சுகளுக்கான பாரபட்சமான மாதிரி செயல்திறனைக் காட்டுகிறது.f நிகழ்தகவு மதிப்புகள் 6-20 மிமீ அளவுள்ள முடிச்சுகளுக்கான லாஜிஸ்டிக் பின்னடைவு மாதிரியின் அடிப்படையில் கணக்கிடப்பட்டது.சாம்பல் புள்ளியிடப்பட்ட கோடு உகந்த வெட்டு மதிப்பைக் குறிக்கிறது (0.455).மேலே உள்ள எண்கள் லாஸ் ஏஞ்சல்ஸுக்கு திட்டமிடப்பட்ட வழக்குகளின் சதவீதத்தைக் குறிக்கின்றன.இரண்டு வால் கொண்ட மாணவர்களின் டி சோதனையைப் பயன்படுத்தவும்.பிசிஏ, முதன்மை கூறு பகுப்பாய்வு.வளைவின் கீழ் AUC பகுதி.மூல தரவு மூல தரவு கோப்புகளின் வடிவத்தில் வழங்கப்படுகிறது.
முன்மொழியப்பட்ட வீரியம் கணிப்பு மாதிரியின் (படம் 4a, b) செயல்திறனை விளக்குவதற்கு ஒரே மாதிரியான நுரையீரல் முடிச்சு அளவுகள் (7-9 மிமீ) கொண்ட நான்கு மாதிரிகள் (வயது 44-61) மேலும் தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டன.ஆரம்ப ஸ்கிரீனிங்கில், கேஸ் 1, தீங்கற்ற தன்மையுடன் தொடர்புடைய ஒரு அம்சமான கால்சிஃபிகேஷன் கொண்ட திடமான முடிச்சாக வழங்கப்பட்டது, அதேசமயம் கேஸ் 2 வெளிப்படையான தீங்கற்ற அம்சங்கள் ஏதுமில்லாத பகுதியளவு திடமான முடிச்சாகக் காட்டப்பட்டது.பின்தொடர்தல் CT ஸ்கேன்களின் மூன்று சுற்றுகள் இந்த வழக்குகள் 4 வருட காலப்பகுதியில் நிலையானதாக இருப்பதைக் காட்டியது, எனவே அவை தீங்கற்ற முடிச்சுகளாகக் கருதப்பட்டன (படம் 4a).தொடர் CT ஸ்கேன்களின் மருத்துவ மதிப்பீட்டோடு ஒப்பிடும்போது, ​​தற்போதைய வகைப்படுத்தி மாதிரியுடன் கூடிய ஒற்றை-ஷாட் சீரம் மெட்டாபொலைட் பகுப்பாய்வு நிகழ்தகவுக் கட்டுப்பாடுகளின் அடிப்படையில் இந்த தீங்கற்ற முடிச்சுகளை விரைவாகவும் சரியாகவும் அடையாளம் கண்டுள்ளது (அட்டவணை 1).வழக்கு 3 இல் உள்ள படம் 4b ப்ளூரல் பின்வாங்கலின் அறிகுறிகளுடன் ஒரு முடிச்சு காட்டுகிறது, இது பெரும்பாலும் வீரியத்துடன் தொடர்புடையது32.வழக்கு 4 தீங்கற்ற காரணத்திற்கான எந்த ஆதாரமும் இல்லாமல் ஒரு உறுதியற்ற பகுதியளவு திடமான முடிச்சாக முன்வைக்கப்பட்டது.இந்த வழக்குகள் அனைத்தும் வகைப்படுத்தி மாதிரியின் படி வீரியம் மிக்கதாக கணிக்கப்பட்டது (அட்டவணை 1).நுரையீரல் அடினோகார்சினோமாவின் மதிப்பீடு நுரையீரல் அறுவைசிகிச்சைக்குப் பிறகு ஹிஸ்டோபோதாலஜிக்கல் பரிசோதனை மூலம் நிரூபிக்கப்பட்டது (படம் 4 பி).வெளிப்புற சரிபார்ப்பு தொகுப்பிற்கு, வளர்சிதை மாற்ற வகைப்படுத்தி 6 மிமீ விட பெரிய நிச்சயமற்ற நுரையீரல் முடிச்சுகளின் இரண்டு நிகழ்வுகளை துல்லியமாக கணித்துள்ளது (துணை படம் 10).
தீங்கற்ற முடிச்சுகளின் இரண்டு நிகழ்வுகளின் நுரையீரலின் அச்சு சாளரத்தின் CT படங்கள்.வழக்கு 1 இல், 4 ஆண்டுகளுக்குப் பிறகு CT ஸ்கேன் வலது கீழ் மடலில் கால்சிஃபிகேஷன் கொண்ட நிலையான திடமான முடிச்சு 7 மிமீ அளவைக் காட்டியது.வழக்கு 2 இல், 5 ஆண்டுகளுக்குப் பிறகு CT ஸ்கேன் வலது மேல் மடலில் 7 மிமீ விட்டம் கொண்ட நிலையான, பகுதியளவு திடமான முடிச்சு கண்டறியப்பட்டது.b நுரையீரலின் அச்சு ஜன்னல் CT படங்கள் மற்றும் நுரையீரல் பிரித்தலுக்கு முன் நிலை I அடினோகார்சினோமாவின் இரண்டு நிகழ்வுகளின் தொடர்புடைய நோயியல் ஆய்வுகள்.வழக்கு 3 ப்ளூரல் பின்வாங்கலுடன் வலது மேல் மடலில் 8 மிமீ விட்டம் கொண்ட ஒரு முடிச்சு வெளிப்படுத்தப்பட்டது.வழக்கு 4 இடது மேல் மடலில் 9 மிமீ அளவுள்ள பகுதியளவு திடமான தரை-கண்ணாடி முடிச்சு வெளிப்படுத்தியது.ஹீமாடாக்சிலின் மற்றும் ஈசின் (H&E) நுரையீரல் திசுக்களின் கறை (ஸ்கேல் பார் = 50 μm) நுரையீரல் அடினோகார்சினோமாவின் அசினார் வளர்ச்சி முறையை நிரூபிக்கிறது.அம்புகள் CT படங்களில் கண்டறியப்பட்ட முடிச்சுகளைக் குறிக்கின்றன.H&E படங்கள் நோயியல் நிபுணரால் பரிசோதிக்கப்பட்ட பல (>3) நுண்ணிய புலங்களின் பிரதிநிதித்துவப் படங்கள்.
ஒன்றாக எடுத்துக்கொண்டால், நுரையீரல் முடிச்சுகளின் வேறுபட்ட நோயறிதலில் சீரம் மெட்டாபொலைட் பயோமார்க்ஸர்களின் சாத்தியமான மதிப்பை எங்கள் முடிவுகள் நிரூபிக்கின்றன, இது CT ஸ்கிரீனிங்கை மதிப்பிடும்போது சவால்களை ஏற்படுத்தக்கூடும்.
சரிபார்க்கப்பட்ட வேறுபட்ட வளர்சிதை மாற்றக் குழுவின் அடிப்படையில், முக்கிய வளர்சிதை மாற்றங்களின் உயிரியல் தொடர்புகளை அடையாளம் காண முயன்றோம்.MetaboAnalyst மூலம் KEGG பாதை செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வு இரண்டு கொடுக்கப்பட்ட குழுக்களுக்கு இடையே 6 பொதுவான குறிப்பிடத்தக்க மாற்றப்பட்ட பாதைகளை அடையாளம் கண்டுள்ளது (LA vs. HC மற்றும் LA vs. BN, சரிசெய்யப்பட்டது p ≤ 0.001, விளைவு > 0.01).இந்த மாற்றங்கள் பைருவேட் வளர்சிதை மாற்றம், டிரிப்டோபான் வளர்சிதை மாற்றம், நியாசின் மற்றும் நிகோடினமைடு வளர்சிதை மாற்றம், கிளைகோலிசிஸ், டிசிஏ சுழற்சி மற்றும் பியூரின் வளர்சிதை மாற்றம் (படம் 5a) ஆகியவற்றில் தொந்தரவுகளால் வகைப்படுத்தப்படுகின்றன.முழுமையான அளவீட்டைப் பயன்படுத்தி பெரிய மாற்றங்களைச் சரிபார்க்க இலக்கு வளர்சிதை மாற்றங்களை நாங்கள் மேலும் செய்தோம்.உண்மையான மெட்டாபொலைட் தரங்களைப் பயன்படுத்தி டிரிபிள் குவாட்ரூபோல் மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி (QQQ) மூலம் பொதுவாக மாற்றப்பட்ட பாதைகளில் பொதுவான வளர்சிதை மாற்றங்களைத் தீர்மானித்தல்.வளர்சிதை மாற்ற ஆய்வு இலக்கு மாதிரியின் மக்கள்தொகை பண்புகள் துணை அட்டவணை 4 இல் சேர்க்கப்பட்டுள்ளன. எங்கள் உலகளாவிய வளர்சிதை மாற்ற முடிவுகளுக்கு இணங்க, அளவு பகுப்பாய்வு BN மற்றும் HC உடன் ஒப்பிடும்போது LA இல் ஹைபோக்சாந்தைன் மற்றும் சாந்தைன், பைருவேட் மற்றும் லாக்டேட் அதிகரித்துள்ளது என்பதை உறுதிப்படுத்தியது (படம். 5b, c, ப <0.05).இருப்பினும், இந்த வளர்சிதை மாற்றங்களில் குறிப்பிடத்தக்க வேறுபாடுகள் BN மற்றும் HC க்கு இடையில் காணப்படவில்லை.
BN மற்றும் HC குழுக்களுடன் ஒப்பிடும்போது LA குழுவில் உள்ள குறிப்பிடத்தக்க வேறுபட்ட வளர்சிதை மாற்றங்களின் KEGG பாதை செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வு.இரண்டு வால் கொண்ட குளோபல்டெஸ்ட் பயன்படுத்தப்பட்டது, மேலும் p மதிப்புகள் ஹோல்ம்-போன்ஃபெரோனி முறையைப் பயன்படுத்தி சரிசெய்யப்பட்டன (சரிசெய்யப்பட்ட p ≤ 0.001 மற்றும் விளைவு அளவு > 0.01).LC-MS/MS (ஒரு குழுவிற்கு n = 70) மூலம் சீரம் HC, BN மற்றும் LA இல் ஹைபோக்சாந்தைன், சாந்தைன், லாக்டேட், பைருவேட் மற்றும் டிரிப்டோபான் அளவுகளைக் காட்டும் b-d வயலின் அடுக்குகள்.வெள்ளை மற்றும் கருப்பு புள்ளியிடப்பட்ட கோடுகள் முறையே சராசரி மற்றும் காலாண்டுகளைக் குறிக்கின்றன.LUAD-TCGA தரவுத்தொகுப்பில் உள்ள சாதாரண நுரையீரல் திசுக்களுடன் (n = 59) ஒப்பிடும்போது நுரையீரல் அடினோகார்சினோமாவில் (n = 513) SLC7A5 மற்றும் QPRT இன் இயல்பாக்கப்பட்ட Log2TPM (டிரான்ஸ்கிரிப்ட்கள் ஒரு மில்லியனுக்கு) mRNA வெளிப்பாடு காட்டும் e Violin plot.வெள்ளைப் பெட்டி இடைக்கால வரம்பைக் குறிக்கிறது, மையத்தில் உள்ள கிடைமட்ட கருப்புக் கோடு இடைநிலையைக் குறிக்கிறது, மற்றும் பெட்டியிலிருந்து நீண்டிருக்கும் செங்குத்து கருப்புக் கோடு 95% நம்பிக்கை இடைவெளியைக் (CI) குறிக்கிறது.நுரையீரல் அடினோகார்சினோமாவில் (n = 513) மற்றும் TCGA தரவுத்தொகுப்பில் சாதாரண நுரையீரல் திசுவில் (n = 59) SLC7A5 மற்றும் GAPDH வெளிப்பாடு ஆகியவற்றின் பியர்சன் தொடர்புத் திட்டம்.சாம்பல் பகுதி 95% CI ஐக் குறிக்கிறது.r, பியர்சன் தொடர்பு குணகம்.g LC-MS/MS ஆல் நிர்ணயிக்கப்பட்ட குறிப்பிடப்படாத shRNA கட்டுப்பாடு (NC) மற்றும் shSLC7A5 (Sh1, Sh2) மூலம் மாற்றப்பட்ட A549 கலங்களில் இயல்பான செல்லுலார் டிரிப்டோபான் அளவுகள்.ஒவ்வொரு குழுவிலும் ஐந்து உயிரியல் ரீதியாக சுயாதீன மாதிரிகளின் புள்ளிவிவர பகுப்பாய்வு வழங்கப்படுகிறது.h செல்லுலார் அளவுகள் NADt (மொத்த NAD, NAD+ மற்றும் NADH உட்பட) A549 கலங்களில் (NC) மற்றும் SLC7A5 நாக் டவுன் A549 செல்கள் (Sh1, Sh2).ஒவ்வொரு குழுவிலும் மூன்று உயிரியல் ரீதியாக சுயாதீன மாதிரிகளின் புள்ளிவிவர பகுப்பாய்வு வழங்கப்படுகிறது.i SLC7A5 நாக் டவுனுக்கு முன்னும் பின்னும் A549 கலங்களின் கிளைகோலைடிக் செயல்பாடு எக்ஸ்ட்ராசெல்லுலர் அமிலமயமாக்கல் வீதத்தால் (ECAR) அளவிடப்பட்டது (ஒரு குழுவிற்கு n = 4 உயிரியல் ரீதியாக சுயாதீன மாதிரிகள்).2-DG,2-deoxy-D-குளுக்கோஸ்.(b-h) இல் இரு வால் மாணவர்களின் t சோதனை பயன்படுத்தப்பட்டது.(g-i) இல், பிழை பார்கள் சராசரி ± SD ஐக் குறிக்கின்றன, ஒவ்வொரு பரிசோதனையும் மூன்று முறை சுயாதீனமாக செய்யப்பட்டது மற்றும் முடிவுகள் ஒரே மாதிரியாக இருந்தன.மூல தரவு மூல தரவு கோப்புகளின் வடிவத்தில் வழங்கப்படுகிறது.
LA குழுவில் மாற்றப்பட்ட டிரிப்டோபான் வளர்சிதை மாற்றத்தின் குறிப்பிடத்தக்க தாக்கத்தை கருத்தில் கொண்டு, QQQ ஐப் பயன்படுத்தி HC, BN மற்றும் LA குழுக்களில் சீரம் டிரிப்டோபான் அளவையும் மதிப்பீடு செய்தோம்.HC அல்லது BN (p <0.001, படம் 5d) உடன் ஒப்பிடும்போது LA இல் சீரம் டிரிப்டோபான் குறைக்கப்பட்டிருப்பதைக் கண்டறிந்தோம், இது நுரையீரல் புற்றுநோயால் பாதிக்கப்பட்ட நோயாளிகளில் டிரிப்டோபான் அளவு குறைவாக உள்ளது என்ற முந்தைய கண்டுபிடிப்புகளுடன் ஒத்துப்போகிறது. ,35.PET/CT ட்ரேசர் 11C-methyl-L-tryptophan ஐப் பயன்படுத்தி மற்றொரு ஆய்வில் நுரையீரல் புற்றுநோய் திசுக்களில் டிரிப்டோபான் சமிக்ஞை தக்கவைப்பு நேரம் தீங்கற்ற புண்கள் அல்லது சாதாரண திசுவுடன் ஒப்பிடும்போது கணிசமாக அதிகரித்துள்ளது.LA சீரத்தில் உள்ள டிரிப்டோபனின் குறைவு நுரையீரல் புற்றுநோய் உயிரணுக்களால் செயலில் உள்ள டிரிப்டோபானைப் பிரதிபலிக்கும் என்று நாங்கள் கருதுகிறோம்.
டிரிப்டோபான் கேடபாலிசத்தின் கினுரேனைன் பாதையின் இறுதி தயாரிப்பு NAD+37,38 என்பதும் அறியப்படுகிறது, இது கிளைகோலிசிஸில் 1,3-பிஸ்பாஸ்போகிளிசரேட்டுடன் கிளைசெரால்டிஹைட்-3-பாஸ்பேட்டின் எதிர்வினைக்கு ஒரு முக்கியமான அடி மூலக்கூறு ஆகும்.முந்தைய ஆய்வுகள் நோயெதிர்ப்பு ஒழுங்குமுறையில் டிரிப்டோபான் கேடபாலிசத்தின் பங்கை மையமாகக் கொண்டிருந்தாலும், தற்போதைய ஆய்வில் காணப்பட்ட டிரிப்டோபான் ஒழுங்குபடுத்தல் மற்றும் கிளைகோலைடிக் பாதைகளுக்கு இடையிலான இடைவெளியை தெளிவுபடுத்த முயன்றோம்.கரைப்பான் டிரான்ஸ்போர்ட்டர் குடும்பம் 7 உறுப்பினர் 5 (SLC7A5) ஒரு டிரிப்டோபன் டிரான்ஸ்போர்ட்டர் என அறியப்படுகிறது43,44,45.குயினோலினிக் அமிலம் பாஸ்போரிபோசைல்ட்ரான்ஸ்ஃபெரேஸ் (QPRT) என்பது கினுரேனைன் பாதையின் கீழ்நோக்கி அமைந்துள்ள ஒரு நொதியாகும், இது குயினோலினிக் அமிலத்தை NAMN46 ஆக மாற்றுகிறது.LUAD TCGA தரவுத்தொகுப்பை ஆய்வு செய்ததில் SLC7A5 மற்றும் QPRT இரண்டும் சாதாரண திசுவுடன் ஒப்பிடும்போது கட்டி திசுக்களில் குறிப்பிடத்தக்க அளவில் கட்டுப்படுத்தப்பட்டுள்ளது (படம் 5e).இந்த அதிகரிப்பு நிலைகள் I மற்றும் II மற்றும் நுரையீரல் அடினோகார்சினோமாவின் III மற்றும் IV நிலைகளில் காணப்பட்டது (துணை படம் 11), இது டிரிப்டோபான் வளர்சிதை மாற்றத்தில் டூமோரிஜெனெசிஸுடன் தொடர்புடைய ஆரம்ப இடையூறுகளைக் குறிக்கிறது.
கூடுதலாக, LUAD-TCGA தரவுத்தொகுப்பு புற்றுநோய் நோயாளி மாதிரிகளில் (r = 0.45, p = 1.55E-26, படம் 5f) SLC7A5 மற்றும் GAPDH mRNA வெளிப்பாட்டிற்கு இடையே ஒரு நேர்மறையான தொடர்பைக் காட்டியது.இதற்கு மாறாக, சாதாரண நுரையீரல் திசுக்களில் (r = 0.25, p = 0.06, படம் 5f) இத்தகைய மரபணு கையொப்பங்களுக்கு இடையே குறிப்பிடத்தக்க தொடர்பு எதுவும் காணப்படவில்லை.A549 கலங்களில் உள்ள SLC7A5 (துணை படம் 12) இன் நாக் டவுன் செல்லுலார் டிரிப்டோபான் மற்றும் NAD(H) அளவைக் கணிசமாகக் குறைத்தது (படம் 5g,h), இதன் விளைவாக எக்ஸ்ட்ராசெல்லுலர் அமிலமயமாக்கல் விகிதம் (ECAR) மூலம் அளவிடப்படும் கிளைகோலைடிக் செயல்பாடு குறைகிறது (படம் 1).5i).எனவே, சீரம் மற்றும் விட்ரோ கண்டறிதலில் வளர்சிதை மாற்ற மாற்றங்களின் அடிப்படையில், டிரிப்டோபான் வளர்சிதை மாற்றம் கினுரேனைன் பாதையின் மூலம் NAD+ ஐ உருவாக்கலாம் மற்றும் நுரையீரல் புற்றுநோயில் கிளைகோலிசிஸை ஊக்குவிப்பதில் முக்கிய பங்கு வகிக்கலாம் என்று நாங்கள் கருதுகிறோம்.
LDCT ஆல் கண்டறியப்பட்ட அதிக எண்ணிக்கையிலான நிச்சயமற்ற நுரையீரல் முடிச்சுகள் PET-CT, நுரையீரல் பயாப்ஸி மற்றும் வீரியம் மிக்க தன்மையின் தவறான-நேர்மறையான நோயறிதலால் அதிகப்படியான சிகிச்சை போன்ற கூடுதல் சோதனைகளின் தேவைக்கு வழிவகுக்கும் என்று ஆய்வுகள் காட்டுகின்றன. படம் 6 இல் காட்டப்பட்டுள்ளபடி, எங்களின் ஆய்வு, CT ஆல் கண்டறியப்பட்ட நுரையீரல் முடிச்சுகளின் இடர் நிலைப்படுத்தல் மற்றும் அடுத்தடுத்த மேலாண்மை ஆகியவற்றை மேம்படுத்தக்கூடிய சாத்தியமான கண்டறியும் மதிப்பைக் கொண்ட சீரம் வளர்சிதை மாற்றங்களின் குழுவை அடையாளம் கண்டுள்ளது.
நுரையீரல் முடிச்சுகள் தீங்கற்ற அல்லது வீரியம் மிக்க காரணங்களைக் குறிக்கும் இமேஜிங் அம்சங்களுடன் குறைந்த-டோஸ் கம்ப்யூட்டட் டோமோகிராபி (LDCT) ஐப் பயன்படுத்தி மதிப்பீடு செய்யப்படுகின்றன.முடிச்சுகளின் நிச்சயமற்ற விளைவு அடிக்கடி பின்தொடர்தல் வருகைகள், தேவையற்ற தலையீடுகள் மற்றும் அதிகப்படியான சிகிச்சைக்கு வழிவகுக்கும்.கண்டறியும் மதிப்புடன் சீரம் வளர்சிதை மாற்ற வகைப்படுத்திகளைச் சேர்ப்பது ஆபத்து மதிப்பீட்டை மேம்படுத்தலாம் மற்றும் நுரையீரல் முடிச்சுகளின் அடுத்தடுத்த நிர்வாகத்தை மேம்படுத்தலாம்.PET பாசிட்ரான் எமிஷன் டோமோகிராபி.
யுஎஸ் என்எல்எஸ்டி ஆய்வு மற்றும் ஐரோப்பிய நெல்சன் ஆய்வின் தரவுகள், குறைந்த-டோஸ் கம்ப்யூட்டட் டோமோகிராபி (எல்டிசிடி) மூலம் அதிக ஆபத்துள்ள குழுக்களை திரையிடுவது நுரையீரல் புற்றுநோய் இறப்பைக் குறைக்கலாம் என்று கூறுகின்றன.எவ்வாறாயினும், LDCT ஆல் கண்டறியப்பட்ட தற்செயலான நுரையீரல் முடிச்சுகளின் ஆபத்து மதிப்பீடு மற்றும் அடுத்தடுத்த மருத்துவ மேலாண்மை ஆகியவை மிகவும் சவாலானதாகவே உள்ளது.நம்பகமான பயோமார்க்ஸர்களை இணைப்பதன் மூலம் தற்போதுள்ள LDCT அடிப்படையிலான நெறிமுறைகளின் சரியான வகைப்பாட்டை மேம்படுத்துவதே முக்கிய குறிக்கோள்.
நுரையீரல் புற்றுநோயை ஆரோக்கியமான கட்டுப்பாடுகளுடன் ஒப்பிடுவதன் மூலம் இரத்த வளர்சிதை மாற்றங்கள் போன்ற சில மூலக்கூறு பயோமார்க்ஸர்கள் அடையாளம் காணப்பட்டுள்ளன15,17.தற்போதைய ஆய்வில், LDCT ஆல் தற்செயலாக கண்டறியப்பட்ட தீங்கற்ற மற்றும் வீரியம் மிக்க நுரையீரல் முடிச்சுகளை வேறுபடுத்துவதற்கு சீரம் வளர்சிதை மாற்ற பகுப்பாய்வு பயன்பாட்டில் கவனம் செலுத்தினோம்.UPLC-HRMS பகுப்பாய்வைப் பயன்படுத்தி ஆரோக்கியமான கட்டுப்பாடு (HC), தீங்கற்ற நுரையீரல் முடிச்சுகள் (BN) மற்றும் நிலை I நுரையீரல் அடினோகார்சினோமா (LA) மாதிரிகளின் உலகளாவிய சீரம் வளர்சிதை மாற்றத்தை ஒப்பிட்டுப் பார்த்தோம்.HC மற்றும் BN க்கு ஒரே மாதிரியான வளர்சிதை மாற்ற சுயவிவரங்கள் இருப்பதை நாங்கள் கண்டறிந்தோம், அதேசமயம் HC மற்றும் BN உடன் ஒப்பிடும்போது LA குறிப்பிடத்தக்க மாற்றங்களைக் காட்டியது.HC மற்றும் BN இலிருந்து LA ஐ வேறுபடுத்தும் இரண்டு சீரம் வளர்சிதை மாற்றங்களை நாங்கள் கண்டறிந்தோம்.
தீங்கற்ற மற்றும் வீரியம் மிக்க முடிச்சுகளுக்கான தற்போதைய LDCT-அடிப்படையிலான அடையாளத் திட்டம் முக்கியமாக அளவு, அடர்த்தி, உருவவியல் மற்றும் காலப்போக்கில் முடிச்சுகளின் வளர்ச்சி விகிதம் ஆகியவற்றை அடிப்படையாகக் கொண்டது30.முந்தைய ஆய்வுகள் முடிச்சுகளின் அளவு நுரையீரல் புற்றுநோயின் சாத்தியத்துடன் நெருக்கமாக தொடர்புடையது என்பதைக் காட்டுகிறது.அதிக ஆபத்துள்ள நோயாளிகளில் கூட, <6 மிமீ முனைகளில் வீரியம் ஏற்படும் அபாயம் <1% ஆகும்.6 முதல் 20 மிமீ அளவுள்ள முடிச்சுகளுக்கு வீரியம் மிக்க ஆபத்து 8% முதல் 64%30 வரை இருக்கும்.எனவே, ஃப்ளீஷ்னர் சொசைட்டி வழக்கமான CT ஃபாலோ-அப்பிற்கு 6 மிமீ வெட்டு விட்டத்தை பரிந்துரைக்கிறது.[29] இருப்பினும், 6 மி.மீ.க்கு மேல் உள்ள உறுதியற்ற நுரையீரல் முடிச்சுகளின் (IPN) இடர் மதிப்பீடு மற்றும் மேலாண்மை ஆகியவை போதுமான அளவில் செய்யப்படவில்லை.பிறவி இதய நோயின் தற்போதைய மேலாண்மை பொதுவாக CT கண்காணிப்புடன் கவனமாக காத்திருப்பதை அடிப்படையாகக் கொண்டது.
சரிபார்க்கப்பட்ட வளர்சிதை மாற்றத்தின் அடிப்படையில், ஆரோக்கியமான நபர்கள் மற்றும் தீங்கற்ற முடிச்சுகள் <6 மிமீ இடையே வளர்சிதை மாற்ற கையொப்பங்களின் மேலோட்டத்தை நாங்கள் முதல் முறையாக நிரூபித்தோம்.உயிரியல் ஒற்றுமை முந்தைய CT கண்டுபிடிப்புகளுடன் ஒத்துப்போனது <6 மி.மீ.க்கு வீரியம் குறையும் அபாயம் முனைகள் இல்லாத பாடங்களுக்கு குறைவாக உள்ளது. வளர்சிதை மாற்ற சுயவிவரங்களில் உள்ள ஒற்றுமை, முடிச்சு அளவைப் பொருட்படுத்தாமல் தீங்கற்ற நோயியலின் செயல்பாட்டு வரையறை சீரானது என்று பரிந்துரைக்கிறது.எனவே, நவீன நோயறிதல் சீரம் மெட்டாபொலைட் பேனல்கள், CT இல் முடிச்சுகள் ஆரம்பத்தில் கண்டறியப்பட்டால் மற்றும் தொடர் கண்காணிப்பைக் குறைக்கும் போது, ​​ஒரு விதி-அவுட் சோதனையாக ஒற்றை மதிப்பீட்டை வழங்கலாம்.அதே நேரத்தில், வளர்சிதை மாற்ற பயோமார்க்ஸர்களின் அதே குழு, தீங்கற்ற முடிச்சுகளிலிருந்து ≥6 மிமீ அளவுள்ள வீரியம் மிக்க முடிச்சுகளை வேறுபடுத்தி, அதே அளவு மற்றும் CT படங்களில் தெளிவற்ற உருவவியல் அம்சங்களைக் கொண்ட IPNகளுக்கான துல்லியமான கணிப்புகளை வழங்கியது.இந்த சீரம் வளர்சிதை மாற்ற வகைப்படுத்தி 0.927 AUC உடன் முடிச்சுகளின் வீரியம் ≥6 மிமீ கணிப்பதில் சிறப்பாக செயல்பட்டது.ஒன்றாக எடுத்துக்கொண்டால், தனித்துவமான சீரம் வளர்சிதை மாற்ற கையொப்பங்கள் ஆரம்பகால கட்டியால் தூண்டப்பட்ட வளர்சிதை மாற்ற மாற்றங்களை குறிப்பாக பிரதிபலிக்கக்கூடும் என்பதையும், முடிச்சு அளவைப் பொருட்படுத்தாமல் ஆபத்து முன்கணிப்பாளர்களாக சாத்தியமான மதிப்பைக் கொண்டிருக்கக்கூடும் என்பதையும் எங்கள் முடிவுகள் குறிப்பிடுகின்றன.
குறிப்பிடத்தக்க வகையில், நுரையீரல் அடினோகார்சினோமா (LUAD) மற்றும் ஸ்குவாமஸ் செல் கார்சினோமா (LUSC) ஆகியவை சிறிய அல்லாத உயிரணு நுரையீரல் புற்றுநோயின் (NSCLC) முக்கிய வகைகளாகும்.LUSC ஆனது புகையிலை பயன்பாட்டுடன் வலுவாக தொடர்புடையது.வாங் மற்றும் சகாக்களும் LUAD இல் கவனம் செலுத்தினர் மற்றும் ஆரோக்கியமான நபர்களிடமிருந்து ஆரம்ப கட்ட நுரையீரல் புற்றுநோயை வேறுபடுத்துவதற்கு லிப்பிடோமிக்ஸைப் பயன்படுத்தி ஒன்பது லிப்பிட் கையொப்பங்களை அடையாளம் கண்டனர்.16 நிலை I LUSC மற்றும் 74 தீங்கற்ற முடிச்சுகளில் தற்போதைய வகைப்படுத்தி மாதிரியை நாங்கள் சோதித்தோம் மற்றும் குறைந்த LUSC கணிப்பு துல்லியத்தை (AUC 0.776) கவனித்தோம்.உண்மையில், LUAD மற்றும் LUSC ஆகியவை நோயியல், உயிரியல் தோற்றம் மற்றும் மரபணு மாறுபாடுகள் ஆகியவற்றில் வேறுபடுகின்றன.எனவே, ஸ்கிரீனிங் திட்டங்களில் நுரையீரல் புற்றுநோயை மக்கள் தொகை அடிப்படையில் கண்டறிவதற்கான பயிற்சி மாதிரிகளில் மற்ற வகை ஹிஸ்டாலஜி சேர்க்கப்பட வேண்டும்.
ஆரோக்கியமான கட்டுப்பாடுகள் மற்றும் தீங்கற்ற முடிச்சுகளுடன் ஒப்பிடும்போது நுரையீரல் அடினோகார்சினோமாவில் அடிக்கடி மாற்றப்பட்ட ஆறு பாதைகளை இங்கே அடையாளம் கண்டோம்.சாந்தைன் மற்றும் ஹைபோக்சாந்தைன் ஆகியவை பியூரின் வளர்சிதை மாற்ற பாதையின் பொதுவான வளர்சிதை மாற்றங்களாகும்.எங்கள் முடிவுகளுக்கு இணங்க, நுரையீரல் அடினோகார்சினோமா நோயாளிகளின் சீரம் அல்லது திசுக்களில் பியூரின் வளர்சிதை மாற்றத்துடன் தொடர்புடைய இடைநிலைகள் ஆரோக்கியமான கட்டுப்பாடுகள் அல்லது 15,50 க்கு முந்தைய நிலையில் உள்ள நோயாளிகளுடன் ஒப்பிடும்போது கணிசமாக அதிகரித்தன.உயர்த்தப்பட்ட சீரம் சாந்தைன் மற்றும் ஹைபோக்சாந்தைன் அளவுகள் புற்றுநோய் செல்களை வேகமாகப் பெருக்குவதற்குத் தேவையான அனபோலிசத்தை பிரதிபலிக்கக்கூடும்.குளுக்கோஸ் வளர்சிதை மாற்றத்தின் சீர்குலைவு என்பது புற்றுநோய் வளர்சிதை மாற்றத்தின் நன்கு அறியப்பட்ட அடையாளமாகும்.இங்கே, HC மற்றும் BN குழுவுடன் ஒப்பிடும்போது LA குழுவில் பைருவேட் மற்றும் லாக்டேட்டில் குறிப்பிடத்தக்க அதிகரிப்பு இருப்பதைக் கண்டோம், இது சிறிய அல்லாத உயிரணு நுரையீரல் புற்றுநோய் (NSCLC) நோயாளிகளின் சீரம் வளர்சிதை மாற்ற சுயவிவரங்களில் கிளைகோலைடிக் பாதை அசாதாரணங்களின் முந்தைய அறிக்கைகளுடன் ஒத்துப்போகிறது. ஆரோக்கியமான கட்டுப்பாடுகள்.முடிவுகள் சீரான 52,53.
முக்கியமாக, நுரையீரல் அடினோகார்சினோமாக்களின் சீரத்தில் பைருவேட் மற்றும் டிரிப்டோபான் வளர்சிதை மாற்றத்திற்கு இடையே ஒரு தலைகீழ் தொடர்பை நாங்கள் கவனித்தோம்.HC அல்லது BN குழுவுடன் ஒப்பிடும்போது LA குழுவில் சீரம் டிரிப்டோபான் அளவுகள் குறைக்கப்பட்டன.சுவாரஸ்யமாக, ஒரு வருங்கால ஒருங்கிணைப்பைப் பயன்படுத்தி முந்தைய பெரிய அளவிலான ஆய்வில் குறைந்த அளவு டிரிப்டோபான் சுழற்சி நுரையீரல் புற்றுநோயின் அபாயத்துடன் தொடர்புடையது என்று கண்டறியப்பட்டது 54 .டிரிப்டோபான் ஒரு அத்தியாவசிய அமினோ அமிலமாகும், இது நாம் முழுவதுமாக உணவில் இருந்து பெறுகிறோம்.நுரையீரல் அடினோகார்சினோமாவில் சீரம் டிரிப்டோபான் குறைவு இந்த வளர்சிதை மாற்றத்தின் விரைவான குறைவை பிரதிபலிக்கும் என்று நாங்கள் முடிவு செய்கிறோம்.கினுரேனைன் பாதை வழியாக டிரிப்டோபான் கேடபாலிசத்தின் இறுதி தயாரிப்பு டி நோவோ என்ஏடி+ தொகுப்பின் மூலமாகும் என்பது அனைவரும் அறிந்ததே.NAD+ முதன்மையாக காப்புப் பாதை மூலம் உற்பத்தி செய்யப்படுவதால், உடல்நலம் மற்றும் நோய்களில் டிரிப்டோபான் வளர்சிதை மாற்றத்தில் NAD+ இன் முக்கியத்துவம் தீர்மானிக்கப்பட உள்ளது.TCGA தரவுத்தளத்தின் எங்கள் பகுப்பாய்வு, டிரிப்டோபான் டிரான்ஸ்போர்ட்டர் கரைசல் டிரான்ஸ்போர்ட்டர் 7A5 (SLC7A5) இன் வெளிப்பாடு நுரையீரல் அடினோகார்சினோமாவில் சாதாரண கட்டுப்பாடுகளுடன் ஒப்பிடும்போது கணிசமாக அதிகரித்துள்ளது மற்றும் கிளைகோலைடிக் என்சைம் GAPDH இன் வெளிப்பாட்டுடன் நேர்மறையான தொடர்பு உள்ளது என்பதைக் காட்டுகிறது.முந்தைய ஆய்வுகள் முக்கியமாக ஆன்டிடூமர் நோயெதிர்ப்பு மறுமொழியை அடக்குவதில் டிரிப்டோபான் கேடபாலிசத்தின் பங்கில் கவனம் செலுத்தியுள்ளன40,41,42.நுரையீரல் புற்றுநோய் உயிரணுக்களில் SLC7A5 ஐ நாக் டவுன் செய்வதன் மூலம் டிரிப்டோபான் எடுத்துக்கொள்வதைத் தடுப்பதால், செல்லுலார் NAD அளவுகள் அடுத்தடுத்து குறைந்து, கிளைகோலைடிக் செயல்பாட்டின் ஒத்திசைவு குறைவதை இங்கு நாங்கள் நிரூபிக்கிறோம்.சுருக்கமாக, நுரையீரல் அடினோகார்சினோமாவின் வீரியம் மிக்க மாற்றத்துடன் தொடர்புடைய சீரம் வளர்சிதை மாற்றத்தில் ஏற்படும் மாற்றங்களுக்கான உயிரியல் அடிப்படையை எங்கள் ஆய்வு வழங்குகிறது.
EGFR பிறழ்வுகள் NSCLC நோயாளிகளுக்கு மிகவும் பொதுவான இயக்கி பிறழ்வுகள் ஆகும்.எங்கள் ஆய்வில், EGFR பிறழ்வு கொண்ட நோயாளிகள் (n = 41) காட்டு-வகை EGFR (n = 31) நோயாளிகளைப் போலவே ஒட்டுமொத்த வளர்சிதை மாற்ற சுயவிவரங்களைக் கொண்டிருப்பதைக் கண்டறிந்தோம், இருப்பினும் அசைல்கார்னைடைன் நோயாளிகளில் சில EGFR விகாரி நோயாளிகளின் சீரம் அளவுகள் குறைவதைக் கண்டறிந்தோம்.அசைல்கார்னிடைன்களின் நிறுவப்பட்ட செயல்பாடு, சைட்டோபிளாஸத்திலிருந்து அசைல் குழுக்களை மைட்டோகாண்ட்ரியல் மேட்ரிக்ஸுக்குள் கொண்டு செல்வதாகும், இது ஆற்றலை உற்பத்தி செய்ய கொழுப்பு அமிலங்களின் ஆக்சிஜனேற்றத்திற்கு வழிவகுக்கிறது.எங்கள் கண்டுபிடிப்புகளுக்கு இணங்க, சமீபத்திய ஆய்வு 102 நுரையீரல் அடினோகார்சினோமா திசு மாதிரிகளின் உலகளாவிய வளர்சிதை மாற்றத்தை பகுப்பாய்வு செய்வதன் மூலம் EGFR விகாரி மற்றும் EGFR காட்டு-வகை கட்டிகளுக்கு இடையில் ஒத்த வளர்சிதை மாற்ற சுயவிவரங்களை அடையாளம் கண்டுள்ளது.சுவாரஸ்யமாக, ஈஜிஎஃப்ஆர் விகாரி குழுவிலும் அசைல்கார்னைடைன் உள்ளடக்கம் காணப்பட்டது.எனவே, அசைல்கார்னைடைன் அளவுகளில் ஏற்படும் மாற்றங்கள் EGFR-தூண்டப்பட்ட வளர்சிதை மாற்றங்களை பிரதிபலிக்கின்றனவா மற்றும் அடிப்படை மூலக்கூறு பாதைகள் மேலும் ஆய்வுக்கு தகுதியுடையதாக இருக்கலாம்.
முடிவில், நுரையீரல் முடிச்சுகளின் வேறுபட்ட நோயறிதலுக்கான சீரம் வளர்சிதை மாற்ற வகைப்படுத்தியை எங்கள் ஆய்வு நிறுவுகிறது மற்றும் இடர் மதிப்பீட்டை மேம்படுத்தும் மற்றும் CT ஸ்கேன் ஸ்கிரீனிங்கின் அடிப்படையில் மருத்துவ நிர்வாகத்தை எளிதாக்கும் பணிப்பாய்வுகளை முன்மொழிகிறது.
இந்த ஆய்வுக்கு சன் யாட்-சென் பல்கலைக்கழக புற்றுநோய் மருத்துவமனையின் நெறிமுறைகள் குழு, சன் யாட்-சென் பல்கலைக்கழகத்தின் முதல் இணைந்த மருத்துவமனை மற்றும் ஜெங்ஜோ பல்கலைக்கழக புற்றுநோய் மருத்துவமனையின் நெறிமுறைகள் குழு ஆகியவை ஒப்புதல் அளித்துள்ளன.கண்டுபிடிப்பு மற்றும் உள் சரிபார்ப்புக் குழுக்களில், ஆரோக்கியமான நபர்களிடமிருந்து 174 செரா மற்றும் தீங்கற்ற முடிச்சுகளிலிருந்து 244 செரா புற்றுநோய் கட்டுப்பாடு மற்றும் தடுப்புத் துறை, சன் யாட்-சென் பல்கலைக்கழக புற்றுநோய் மையம் மற்றும் 166 தீங்கற்ற முடிச்சுகளில் ஆண்டு மருத்துவ பரிசோதனைக்கு உட்படுத்தப்பட்ட நபர்களிடமிருந்து சேகரிக்கப்பட்டன.சீரம்.நிலை I நுரையீரல் அடினோகார்சினோமாக்கள் சன் யாட்-சென் பல்கலைக்கழக புற்றுநோய் மையத்திலிருந்து சேகரிக்கப்பட்டன.வெளிப்புற சரிபார்ப்புக் குழுவில், தீங்கற்ற முடிச்சுகளின் 48 வழக்குகள், சன் யாட்-சென் பல்கலைக்கழகத்தின் முதல் இணைந்த மருத்துவமனையிலிருந்து ஸ்டேஜ் I நுரையீரல் அடினோகார்சினோமாவின் 39 வழக்குகள் மற்றும் ஜெங்ஜோ புற்றுநோய் மருத்துவமனையிலிருந்து நிலை I நுரையீரல் அடினோகார்சினோமாவின் 24 வழக்குகள் இருந்தன.சன் யாட்-சென் பல்கலைக்கழக புற்றுநோய் மையம் நிறுவப்பட்ட வளர்சிதை மாற்ற வகைப்படுத்தியின் கண்டறியும் திறனை சோதிக்க, நிலை I ஸ்குவாமஸ் செல் நுரையீரல் புற்றுநோயின் 16 நிகழ்வுகளையும் சேகரித்தது (நோயாளியின் பண்புகள் துணை அட்டவணை 5 இல் காட்டப்பட்டுள்ளன).ஜனவரி 2018 மற்றும் மே 2020 க்கு இடையில் கண்டுபிடிப்புக் குழு மற்றும் உள் சரிபார்ப்புக் குழுவிலிருந்து மாதிரிகள் சேகரிக்கப்பட்டன. ஆகஸ்ட் 2021 மற்றும் அக்டோபர் 2022 க்கு இடையில் வெளிப்புற சரிபார்ப்புக் குழுவிற்கான மாதிரிகள் சேகரிக்கப்பட்டன. பாலின சார்புகளைக் குறைக்க, ஒவ்வொருவருக்கும் தோராயமாக சம எண்ணிக்கையிலான ஆண் மற்றும் பெண் வழக்குகள் ஒதுக்கப்பட்டன. கூட்டு.டிஸ்கவரி குழு மற்றும் உள் ஆய்வுக் குழு.சுய அறிக்கையின் அடிப்படையில் பங்கேற்பாளரின் பாலினம் தீர்மானிக்கப்பட்டது.அனைத்து பங்கேற்பாளர்களிடமிருந்தும் தகவலறிந்த ஒப்புதல் பெறப்பட்டது மற்றும் இழப்பீடு வழங்கப்படவில்லை.பகுப்பாய்வின் போது 2 முதல் 5 ஆண்டுகளில் நிலையான CT ஸ்கேன் மதிப்பெண் பெற்றவர்கள் தீங்கற்ற முடிச்சுகளைக் கொண்டவர்கள், வெளிப்புற சரிபார்ப்பு மாதிரியிலிருந்து 1 வழக்கு தவிர, இது அறுவை சிகிச்சைக்கு முன்பே சேகரிக்கப்பட்டு ஹிஸ்டோபோதாலஜி மூலம் கண்டறியப்பட்டது.நாள்பட்ட மூச்சுக்குழாய் அழற்சியைத் தவிர.நுரையீரல் அடினோகார்சினோமா வழக்குகள் நுரையீரல் பிரித்தலுக்கு முன் சேகரிக்கப்பட்டு நோயியல் நோயறிதலால் உறுதிப்படுத்தப்பட்டன.உண்ணாவிரத இரத்த மாதிரிகள் எந்த ஆன்டிகோகுலண்டுகளும் இல்லாமல் சீரம் பிரிக்கும் குழாய்களில் சேகரிக்கப்பட்டன.இரத்த மாதிரிகள் அறை வெப்பநிலையில் 1 மணிநேரம் உறைந்து பின்னர் சீரம் சூப்பர்நேட்டன்ட்டை சேகரிக்க 4 ° C இல் 10 நிமிடங்களுக்கு 2851 × g இல் மையவிலக்கு செய்யப்பட்டன.வளர்சிதை மாற்றத்தை பிரித்தெடுக்கும் வரை சீரம் அலிகோட்கள் -80 ° C இல் உறைந்தன.சன் யாட்-சென் பல்கலைக்கழக புற்றுநோய் மையத்தின் புற்றுநோய் தடுப்பு மற்றும் மருத்துவப் பரிசோதனைத் துறை 100 ஆரோக்கியமான நன்கொடையாளர்களிடமிருந்து சீரம் தொகுப்பை சேகரித்தது, இதில் 40 முதல் 55 வயதுடைய ஆண்களும் பெண்களும் சம எண்ணிக்கையில் உள்ளனர்.ஒவ்வொரு நன்கொடையாளர் மாதிரியின் சம அளவுகள் கலக்கப்பட்டன, இதன் விளைவாக குளம் அலிகோட் செய்யப்பட்டு -80 ° C இல் சேமிக்கப்பட்டது.சீரம் கலவையானது தரக் கட்டுப்பாடு மற்றும் தரவு தரநிலைப்படுத்தலுக்கு குறிப்புப் பொருளாகப் பயன்படுத்தப்பட்டது.
குறிப்பு சீரம் மற்றும் சோதனை மாதிரிகள் கரைக்கப்பட்டு, ஒருங்கிணைந்த பிரித்தெடுத்தல் முறையை (MTBE/methanol/water) பயன்படுத்தி வளர்சிதை மாற்றங்கள் பிரித்தெடுக்கப்பட்டன.சுருக்கமாக, 50 μl சீரம் 225 μl ஐஸ்-கோல்ட் மெத்தனால் மற்றும் 750 μl ஐஸ்-கோல்ட் மெத்தில் டெர்ட்-பியூட்டில் ஈதர் (MTBE) உடன் கலக்கப்பட்டது.கலவையை கிளறி, 1 மணி நேரம் ஐஸ் மீது அடைகாக்கவும்.மாதிரிகள் பின்னர் கலக்கப்பட்டு சுழல் 188 μl எம்எஸ்-கிரேடு தண்ணீரில் உள் தரநிலைகளைக் கொண்ட (13C-லாக்டேட், 13C3-பைருவேட், 13C-மெத்தியோனைன் மற்றும் 13C6-ஐசோலூசின், கேம்பிரிட்ஜ் ஐசோடோப் ஆய்வகங்களில் இருந்து வாங்கப்பட்டது).கலவையானது பின்னர் 10 நிமிடத்திற்கு 15,000 × g இல் 4 °C இல் மையவிலக்கு செய்யப்பட்டது, மேலும் கீழ் கட்டம் நேர்மறை மற்றும் எதிர்மறை முறைகளில் LC-MS பகுப்பாய்விற்காக இரண்டு குழாய்களாக (தலா 125 μL) மாற்றப்பட்டது.இறுதியாக, மாதிரியானது அதிவேக வெற்றிட செறிவூட்டியில் வறட்சிக்கு ஆவியாகியது.
உலர்ந்த வளர்சிதை மாற்றங்கள் 80% அசிட்டோனிட்ரைலில் 120 μl இல் மறுகட்டமைக்கப்பட்டன, 5 நிமிடங்களுக்கு சுழலிடப்பட்டு, 4 ° C இல் 10 நிமிடங்களுக்கு 15,000 × g இல் மையவிலக்கு செய்யப்பட்டன.வளர்சிதை மாற்ற ஆய்வுகளுக்காக மைக்ரோ இன்சர்ட்களுடன் சூப்பர்நேட்டண்டுகள் ஆம்பர் கண்ணாடி குப்பிகளுக்கு மாற்றப்பட்டன.அல்ட்ரா-செயல்திறன் திரவ குரோமடோகிராபி-உயர்-தெளிவுத்திறன் கொண்ட மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி (UPLC-HRMS) தளத்தில் இலக்கற்ற வளர்சிதை மாற்ற பகுப்பாய்வு.டியோனெக்ஸ் அல்டிமேட் 3000 UPLC அமைப்பு மற்றும் ACQUITY BEH அமைடு நெடுவரிசை (2.1 × 100 மிமீ, 1.7 μm, வாட்டர்ஸ்) ஆகியவற்றைப் பயன்படுத்தி வளர்சிதை மாற்றங்கள் பிரிக்கப்பட்டன.நேர்மறை அயன் பயன்முறையில், மொபைல் கட்டங்கள் 95% (A) மற்றும் 50% அசிட்டோனிட்ரைல் (B), ஒவ்வொன்றும் 10 mmol/L அம்மோனியம் அசிடேட் மற்றும் 0.1% ஃபார்மிக் அமிலம் ஆகியவற்றைக் கொண்டுள்ளது.எதிர்மறை பயன்முறையில், மொபைல் கட்டங்கள் A மற்றும் B முறையே 95% மற்றும் 50% அசிட்டோனிட்ரைலைக் கொண்டிருந்தன, இரண்டு கட்டங்களிலும் 10 mmol/L அம்மோனியம் அசிடேட், pH = 9. சாய்வு நிரல் பின்வருமாறு: 0-0.5 நிமிடம், 2% B;0.5-12 நிமிடம், 2-50% B;12-14 நிமிடம், 50-98% B;14-16 நிமிடம், 98% B;16–16.1.நிமிடம், 98 –2% B;16.1-20 நிமிடம், 2% B. ஆட்டோசாம்ப்ளரில் நெடுவரிசை 40 ° C மற்றும் மாதிரி 10 ° C இல் பராமரிக்கப்பட்டது.ஓட்ட விகிதம் 0.3 மிலி / நிமிடம், ஊசி அளவு 3 μl.எலக்ட்ரோஸ்ப்ரே அயனியாக்கம் (ESI) மூலத்துடன் கூடிய Q-Exactive Orbitrap மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமீட்டர் (தெர்மோ ஃபிஷர் சயின்டிஃபிக்) முழு ஸ்கேன் பயன்முறையில் இயக்கப்பட்டது மற்றும் பெரிய அளவிலான தரவுகளை சேகரிக்க ddMS2 கண்காணிப்பு பயன்முறையுடன் இணைக்கப்பட்டது.MS அளவுருக்கள் பின்வருமாறு அமைக்கப்பட்டன: ஸ்ப்ரே மின்னழுத்தம் +3.8 kV/- 3.2 kV, தந்துகி வெப்பநிலை 320 ° C, கேடயம் வாயு 40 arb, துணை வாயு 10 arb, ஆய்வு ஹீட்டர் வெப்பநிலை 350 ° C, ஸ்கேனிங் வரம்பு 70-1050 m/h, தீர்மானம்.70 000. Xcalibur 4.1 (Thermo Fisher Scientific) ஐப் பயன்படுத்தி தரவு பெறப்பட்டது.
தரவு தரத்தை மதிப்பிடுவதற்கு, ஒவ்வொரு மாதிரியிலிருந்தும் 10 μL அலிகோட்களை அகற்றுவதன் மூலம் பூல் செய்யப்பட்ட தரக் கட்டுப்பாடு (QC) மாதிரிகள் உருவாக்கப்பட்டன.யுபிஎல்சி-எம்எஸ் அமைப்பின் ஸ்திரத்தன்மையை மதிப்பிடுவதற்காக பகுப்பாய்வு வரிசையின் தொடக்கத்தில் ஆறு தரக் கட்டுப்பாட்டு மாதிரி ஊசிகள் பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டன.தரக் கட்டுப்பாட்டு மாதிரிகள் அவ்வப்போது தொகுப்பில் அறிமுகப்படுத்தப்படுகின்றன.இந்த ஆய்வில் உள்ள அனைத்து 11 தொகுதி சீரம் மாதிரிகளும் LC-MS ஆல் பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டன.100 ஆரோக்கியமான நன்கொடையாளர்களிடமிருந்து சீரம் பூல் கலவையின் அலிகோட்கள், பிரித்தெடுக்கும் செயல்முறையைக் கண்காணிக்கவும், தொகுதி-க்கு-தொகுதி விளைவுகளை சரிசெய்யவும் அந்தந்த தொகுதிகளில் குறிப்புப் பொருளாகப் பயன்படுத்தப்பட்டன.சன் யாட்-சென் பல்கலைக்கழகத்தின் வளர்சிதை மாற்ற மையத்தில் கண்டுபிடிப்பு குழு, உள் சரிபார்ப்பு கூட்டு மற்றும் வெளிப்புற சரிபார்ப்பு கூட்டு ஆகியவற்றின் குறிக்கப்படாத வளர்சிதை மாற்ற பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டது.குவாங்டாங் யுனிவர்சிட்டி ஆஃப் டெக்னாலஜி அனாலிசிஸ் அண்ட் டெஸ்டிங் சென்டரின் வெளிப்புற ஆய்வகமானது, வகைப்படுத்தி மாதிரியின் செயல்திறனைச் சோதிக்க வெளிப்புறக் குழுவிலிருந்து 40 மாதிரிகளை ஆய்வு செய்தது.
பிரித்தெடுத்தல் மற்றும் மறுசீரமைப்பிற்குப் பிறகு, பல எதிர்வினை கண்காணிப்பு (MRM) பயன்முறையில் எலக்ட்ரோஸ்ப்ரே அயனியாக்கம் (ESI) மூலத்துடன் அதி-உயர் செயல்திறன் திரவ குரோமடோகிராபி-டேண்டம் மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி (அஜிலன்ட் 6495 டிரிபிள் குவாட்ரூபோல்) பயன்படுத்தி சீரம் வளர்சிதை மாற்றங்களின் முழுமையான அளவு அளவிடப்பட்டது.ஒரு ACQUITY BEH அமைடு நெடுவரிசை (2.1 × 100 மிமீ, 1.7 μm, வாட்டர்ஸ்) வளர்சிதை மாற்றங்களை பிரிக்க பயன்படுத்தப்பட்டது.மொபைல் கட்டத்தில் 90% (A) மற்றும் 5% அசிட்டோனிட்ரைல் (B) 10 mmol/L அம்மோனியம் அசிடேட் மற்றும் 0.1% அம்மோனியா கரைசல் ஆகியவை அடங்கும்.சாய்வு நிரல் பின்வருமாறு: 0-1.5 நிமிடம், 0% B;1.5–6.5 நிமிடம், 0–15% பி;6.5-8 நிமிடம், 15% B;8–8.5 நிமிடம், 15%–0% B;8.5–11.5 நிமிடம், 0% பி.நெடுவரிசை 40 °C ஆகவும், மாதிரி 10 °C ஆகவும் ஆட்டோசாம்ப்ளரில் பராமரிக்கப்பட்டது.ஓட்ட விகிதம் 0.3 mL/min மற்றும் ஊசி அளவு 1 μL.MS அளவுருக்கள் பின்வருமாறு அமைக்கப்பட்டன: தந்துகி மின்னழுத்தம் ±3.5 kV, நெபுலைசர் அழுத்தம் 35 psi, உறை வாயு ஓட்டம் 12 L/min, உறை வாயு வெப்பநிலை 350 ° C, உலர்த்தும் வாயு வெப்பநிலை 250 ° C, மற்றும் உலர்த்தும் வாயு ஓட்டம் 14 l/min.டிரிப்டோபன், பைருவேட், லாக்டேட், ஹைபோக்சாந்தைன் மற்றும் சாந்தைன் ஆகியவற்றின் எம்ஆர்எம் மாற்றங்கள் 205.0–187.9, 87.0–43.4, 89.0–43.3, 135.0–92.3 மற்றும் 151.0–107 ஆகும்.முறையே 9.Mass Hunter B.07.00 (Agilent Technologies) ஐப் பயன்படுத்தி தரவு சேகரிக்கப்பட்டது.சீரம் மாதிரிகளுக்கு, டிரிப்டோபன், பைருவேட், லாக்டேட், ஹைபோக்சாந்தைன் மற்றும் சாந்தைன் ஆகியவை நிலையான கலவை தீர்வுகளின் அளவுத்திருத்த வளைவுகளைப் பயன்படுத்தி அளவிடப்பட்டன.செல் மாதிரிகளுக்கு, டிரிப்டோபான் உள்ளடக்கம் உள் தரநிலை மற்றும் செல் புரத நிறை ஆகியவற்றிற்கு இயல்பாக்கப்பட்டது.
காம்பவுண்ட் டிஸ்கவரி 3.1 மற்றும் ட்ரேஸ்ஃபைண்டர் 4.0 (தெர்மோ ஃபிஷர் சயின்டிஃபிக்) ஆகியவற்றைப் பயன்படுத்தி உச்சப் பிரித்தெடுத்தல் (m/z மற்றும் தக்கவைப்பு நேரம் (RT)) செய்யப்பட்டது.தொகுதிகளுக்கிடையேயான சாத்தியமான வேறுபாடுகளை அகற்ற, சோதனை மாதிரியின் ஒவ்வொரு சிறப்பியல்பு உச்சமும், ஒப்பீட்டு மிகுதியைப் பெற, அதே தொகுப்பிலிருந்து குறிப்புப் பொருளின் சிறப்பியல்பு உச்சத்தால் வகுக்கப்பட்டது.தரப்படுத்தலுக்கு முன்னும் பின்னும் உள்ள உள் தரநிலைகளின் ஒப்பீட்டு நிலையான விலகல்கள் துணை அட்டவணை 6 இல் காட்டப்பட்டுள்ளன. இரு குழுக்களுக்கிடையேயான வேறுபாடுகள் தவறான கண்டுபிடிப்பு விகிதம் (FDR<0.05, Wilcoxon கையொப்பமிடப்பட்ட தரவரிசை சோதனை) மற்றும் மடிப்பு மாற்றம் (>1.2 அல்லது <0.83) ஆகியவற்றால் வகைப்படுத்தப்படுகின்றன.பிரித்தெடுக்கப்பட்ட அம்சங்களின் மூல MS தரவு மற்றும் குறிப்பு சீரம்-சரிசெய்யப்பட்ட MS தரவு முறையே துணைத் தரவு 1 மற்றும் துணைத் தரவு 2 இல் காட்டப்பட்டுள்ளன.அடையாளம் காணப்பட்ட மெட்டாபொலிட்டுகள், தூண்டுதலாக சிறுகுறிப்பு செய்யப்பட்ட சேர்மங்கள், தூண்டுதலாக வகைப்படுத்தப்பட்ட கலவை வகுப்புகள் மற்றும் அறியப்படாத சேர்மங்கள் உட்பட நான்கு வரையறுக்கப்பட்ட அடையாள நிலைகளின் அடிப்படையில் உச்ச சிறுகுறிப்பு செய்யப்பட்டது.காம்பவுண்ட் டிஸ்கவரி 3.1 (mzCloud, HMDB, Chemspider) இல் தரவுத்தளத் தேடல்களின் அடிப்படையில், MS/MS பொருத்தப்பட்ட தரங்களுடன் உயிரியல் சேர்மங்கள் அல்லது mzCloud (மதிப்பெண் > 85) அல்லது Chemspider இல் உள்ள சரியான பொருத்தக் குறிப்புகள் ஆகியவை வேறுபட்ட வளர்சிதை மாற்றத்திற்கு இடையில் இடைநிலைகளாகத் தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டன.ஒவ்வொரு அம்சத்திற்கும் உச்சக் குறிப்புகள் துணைத் தரவு 3 இல் சேர்க்கப்பட்டுள்ளன. மெட்டாபோஅனலிஸ்ட் 5.0, கூட்டு-இயல்பாக்கப்பட்ட மெட்டாபொலைட் மிகுதியின் ஒரே மாதிரியான பகுப்பாய்விற்குப் பயன்படுத்தப்பட்டது.MetaboAnalyst 5.0 ஆனது KEGG பாதை செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வை கணிசமாக வேறுபட்ட வளர்சிதை மாற்றங்களின் அடிப்படையில் மதிப்பீடு செய்தது.முதன்மை கூறு பகுப்பாய்வு (PCA) மற்றும் பகுதி குறைந்தபட்ச சதுரங்கள் பாரபட்சமான பகுப்பாய்வு (PLS-DA) ஆகியவை ஸ்டாக் இயல்பாக்கம் மற்றும் ஆட்டோஸ்கேலிங் மூலம் ropls மென்பொருள் தொகுப்பைப் (v.1.26.4) பயன்படுத்தி பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டன.முடிச்சு வீரியத்தை முன்னறிவிப்பதற்கான உகந்த மெட்டாபொலைட் பயோமார்க்கர் மாதிரியானது பைனரி லாஜிஸ்டிக் ரிக்ரெஷனைப் பயன்படுத்தி குறைந்தது முழுமையான சுருக்கம் மற்றும் தேர்வு ஆபரேட்டர் (LASSO, R தொகுப்பு v.4.1-3) மூலம் உருவாக்கப்பட்டது.கண்டறிதல் மற்றும் சரிபார்ப்புத் தொகுப்புகளில் உள்ள பாரபட்சமான மாதிரியின் செயல்திறன், pROC தொகுப்பின்படி (v.1.18.0.) ROC பகுப்பாய்வின் அடிப்படையில் AUCயை மதிப்பிடுவதன் மூலம் வகைப்படுத்தப்பட்டது.மாதிரியின் அதிகபட்ச யூடென் குறியீட்டின் அடிப்படையில் உகந்த நிகழ்தகவு வெட்டு பெறப்பட்டது (உணர்திறன் + தனித்தன்மை - 1).வாசலை விட குறைவான அல்லது அதிக மதிப்புகள் கொண்ட மாதிரிகள் முறையே தீங்கற்ற முடிச்சுகள் மற்றும் நுரையீரல் அடினோகார்சினோமா என கணிக்கப்படும்.
A549 செல்கள் (#CCL-185, அமெரிக்கன் வகை கலாச்சார சேகரிப்பு) 10% FBS கொண்ட F-12K ஊடகத்தில் வளர்க்கப்பட்டது.SLC7A5 ஐ இலக்காகக் கொண்ட குறுகிய ஹேர்பின் ஆர்என்ஏ (shRNA) வரிசைகள் மற்றும் இலக்கு இல்லாத கட்டுப்பாடு (NC) ஆகியவை லென்டிவைரல் திசையன் pLKO.1-puro இல் செருகப்பட்டன.shSLC7A5 இன் ஆன்டிசென்ஸ் வரிசைகள் பின்வருமாறு: Sh1 (5′-GGAGAAACCTGATGAACAGTT-3′), Sh2 (5′-GCCGTGGACTTCGGGAACTAT-3′).SLC7A5 (#5347) மற்றும் டூபுலின் (#2148) ஆகியவற்றுக்கான ஆன்டிபாடிகள் செல் சிக்னலிங் தொழில்நுட்பத்திலிருந்து வாங்கப்பட்டன.வெஸ்டர்ன் பிளட் பகுப்பாய்விற்கு SLC7A5 மற்றும் டூபுலினுக்கான ஆன்டிபாடிகள் 1:1000 நீர்த்தத்தில் பயன்படுத்தப்பட்டன.
சீஹார்ஸ் எக்ஸ்எஃப் கிளைகோலிடிக் ஸ்ட்ரெஸ் டெஸ்ட் எக்ஸ்ட்ராசெல்லுலர் அமிலமயமாக்கல் (ECAR) அளவை அளவிடுகிறது.மதிப்பீட்டில், குளுக்கோஸ், ஒலிகோமைசின் ஏ மற்றும் 2-டிஜி ஆகியவை ECAR ஆல் அளவிடப்பட்ட செல்லுலார் கிளைகோலைடிக் திறனை சோதிக்க தொடர்ச்சியாக நிர்வகிக்கப்பட்டன.
இலக்கு அல்லாத கட்டுப்பாடு (NC) மற்றும் shSLC7A5 (Sh1, Sh2) மூலம் மாற்றப்பட்ட A549 செல்கள் 10 செமீ விட்டம் கொண்ட உணவுகளில் ஒரே இரவில் பூசப்பட்டன.செல் வளர்சிதை மாற்றங்கள் 1 மில்லி பனி-குளிர் 80% அக்வஸ் மெத்தனால் மூலம் பிரித்தெடுக்கப்பட்டன.மெத்தனால் கரைசலில் உள்ள செல்கள் துடைக்கப்பட்டு, ஒரு புதிய குழாயில் சேகரிக்கப்பட்டு, 15 நிமிடங்களுக்கு 4 ° C வெப்பநிலையில் 15,000 × g இல் மையவிலக்கு செய்யப்பட்டது.800 µl சூப்பர்நேட்டன்ட்டை சேகரித்து, அதிவேக வெற்றிட செறிவூட்டியைப் பயன்படுத்தி உலர்த்தவும்.மேலே விவரிக்கப்பட்டபடி LC-MS/MS ஐப் பயன்படுத்தி டிரிப்டோபான் அளவுகளுக்கு உலர்ந்த வளர்சிதை மாற்றத் துகள்கள் பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டன.உற்பத்தியாளரின் அறிவுறுத்தல்களின்படி A549 கலங்களில் (NC மற்றும் shSLC7A5) செல்லுலார் NAD(H) அளவுகள் அளவு NAD+/NADH வண்ண அளவீட்டு கருவியை (#K337, BioVision) பயன்படுத்தி அளவிடப்பட்டது.வளர்சிதை மாற்றங்களின் அளவை இயல்பாக்குவதற்கு ஒவ்வொரு மாதிரிக்கும் புரத அளவுகள் அளவிடப்பட்டன.
மாதிரி அளவை முன்கூட்டியே தீர்மானிக்க புள்ளிவிவர முறைகள் எதுவும் பயன்படுத்தப்படவில்லை.பயோமார்க்கர் கண்டுபிடிப்பை இலக்காகக் கொண்ட முந்தைய வளர்சிதை மாற்ற ஆய்வுகள் 15,18 அளவை நிர்ணயிப்பதற்கான அளவுகோல்களாகக் கருதப்பட்டன, மேலும் இந்த அறிக்கைகளுடன் ஒப்பிடும்போது, ​​எங்கள் மாதிரி போதுமானதாக இருந்தது.ஆய்வுக் குழுவிலிருந்து மாதிரிகள் எதுவும் விலக்கப்படவில்லை.சீரம் மாதிரிகள் தோராயமாக ஒரு கண்டுபிடிப்பு குழுவிற்கும் (306 வழக்குகள், 74.6%) மற்றும் உள் சரிபார்ப்பு குழுவிற்கும் (104 வழக்குகள், 25.4%) இலக்கற்ற வளர்சிதை மாற்ற ஆய்வுகளுக்கு ஒதுக்கப்பட்டன.இலக்கு வளர்சிதை மாற்ற ஆய்வுகளுக்கான கண்டுபிடிப்பு தொகுப்பிலிருந்து ஒவ்வொரு குழுவிலிருந்தும் தோராயமாக 70 வழக்குகளைத் தேர்ந்தெடுத்தோம்.LC-MS தரவு சேகரிப்பு மற்றும் பகுப்பாய்வின் போது குழு ஒதுக்கீட்டில் புலனாய்வாளர்கள் கண்மூடித்தனமாக இருந்தனர்.வளர்சிதை மாற்ற தரவு மற்றும் செல் பரிசோதனைகளின் புள்ளிவிவர பகுப்பாய்வுகள் அந்தந்த முடிவுகள், ஃபிகர் லெஜண்ட்ஸ் மற்றும் முறைகள் பிரிவுகளில் விவரிக்கப்பட்டுள்ளன.செல்லுலார் டிரிப்டோபான், என்ஏடிடி மற்றும் கிளைகோலைடிக் செயல்பாடு ஆகியவற்றின் அளவீடு ஒரே மாதிரியான முடிவுகளுடன் மூன்று முறை சுயாதீனமாக செய்யப்பட்டது.
ஆய்வு வடிவமைப்பு பற்றிய கூடுதல் தகவலுக்கு, இந்தக் கட்டுரையுடன் தொடர்புடைய இயற்கை போர்ட்ஃபோலியோ அறிக்கை சுருக்கத்தைப் பார்க்கவும்.
பிரித்தெடுக்கப்பட்ட அம்சங்களின் மூல MS தரவு மற்றும் குறிப்பு சீரத்தின் இயல்பாக்கப்பட்ட MS தரவு ஆகியவை முறையே துணைத் தரவு 1 மற்றும் துணைத் தரவு 2 இல் காட்டப்பட்டுள்ளன.வேறுபட்ட அம்சங்களுக்கான உச்சக் குறிப்புகள் துணைத் தரவு 3 இல் வழங்கப்பட்டுள்ளன. LUAD TCGA தரவுத்தொகுப்பை https://portal.gdc.cancer.gov/ இலிருந்து பதிவிறக்கம் செய்யலாம்.வரைபடத்தைத் திட்டமிடுவதற்கான உள்ளீட்டுத் தரவு மூலத் தரவில் கொடுக்கப்பட்டுள்ளது.இந்த கட்டுரைக்கான ஆதார தரவு வழங்கப்படுகிறது.
நேஷனல் லங் ஸ்கிரீனிங் ஸ்டடி க்ரூப், முதலியன. நுரையீரல் புற்றுநோய் இறப்பைக் குறைப்பது குறைந்த டோஸ் கம்ப்யூட்டட் டோமோகிராஃபி.வடக்கு இங்கிலாந்து.ஜே. மெட்365, 395–409 (2011).
கிராமர், பிஎஸ், பெர்க், கேடி, அபெர்லே, டிஆர் மற்றும் ப்ரொஃபெட், பிசி நுரையீரல் புற்றுநோய் பரிசோதனை குறைந்த அளவிலான ஹெலிகல் CT: தேசிய நுரையீரல் ஸ்கிரீனிங் ஆய்வின் (NLST) முடிவுகள்.ஜே. மெட்திரை 18, 109–111 (2011).
டி கோனிங், HJ, மற்றும் பலர்.சீரற்ற சோதனையில் வால்யூமெட்ரிக் CT ஸ்கிரீனிங் மூலம் நுரையீரல் புற்றுநோய் இறப்பைக் குறைத்தல்.வடக்கு இங்கிலாந்து.ஜே. மெட்382, 503–513 (2020).